| Identifikační kód |
RIV/86652036:_____/23:00581603 |
| Název v anglickém jazyce |
Development of a PNGase Rc Column for Online Deglycosylation of Complex Glycoproteins during HDX-MS |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10608 - Biochemistry and molecular biology |
| Rok uplatnění |
2023 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Protein glycosylation is one of the most common PTMs and many cell surface receptors, extracellular proteins, and biopharmaceuticals are glycosylated. However, HDX-MS analysis of such important glycoproteins has so far been limited by difficulties in determining the HDX of the protein segments that contain glycans. We have developed a column containing immobilized PNGase Rc (from Rudaea cellulosilytica) that can readily be implemented into a conventional HDX-MS setup to allow improved analysis of glycoproteins. We show that HDX-MS with the PNGase Rc column enables efficient online removal of N-linked glycans and the determination of the HDX of glycosylated regions in several complex glycoproteins. Additionally, we use the PNGase Rc column to perform a comprehensive HDX-MS mapping of the binding epitope of a mAb to c-Met, a complex glycoprotein drug target. Importantly, the column retains high activity in the presence of common quench-buffer additives like TCEP and urea and performed consistent across 114 days of extensive use. Overall, our work shows that HDX-MS with the integrated PNGase Rc column can enable fast and efficient online deglycosylation at harsh quench conditions to provide comprehensive analysis of complex glycoproteins. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
hydrogen/deuterium exchange;resolution;proteins |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.3c00268 |
| DOI výsledku |
10.1021/jasms.3c00268 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |