Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/68378050:_____/22:00559536 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10608 - Biochemistry and molecular biology |
| Rok uplatnění | 2022 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 8 |
| Počet tvůrců celkem | 12 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ondřej Moravčík (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1895899) Jan Pačes (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5655749, researcherid: C-8851-2009) Barbora Benoni (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Hana Cahová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0002-4986-7858, researcherid: O-4595-2014) Lenka Gahurová (státní příslušnost: SK - Slovenská republika) P. Plevka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Procházková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Veronika Romanská (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Kristina Spustová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Anna Šimonová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) K. Škubník (státní příslušnost: CZ - Česká republika) L. Šmerdová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The Picornavirales include viruses that infect vertebrates, insects, and plants. It was believed that they pack only their genomic mRNA in the particles, thus, we envisaged these viruses as excellent model systems for studies of mRNA modifications. We used LC–MS to analyze digested RNA isolated from particles of the sacbrood and deformed wing iflaviruses as well as of the echovirus 18 and rhinovirus 2 picornaviruses. Whereas in the picornavirus RNAs we detected only N6-methyladenosine and 2’-O-methylated nucleosides, the iflavirus RNAs contained a wide range of methylated nucleosides, such as 1-methyladenosine (m1A) and 5-methylcytidine (m5C). Mapping of m1A and m5C through RNA sequencing of the SBV and DWV RNAs revealed the presence of tRNA molecules. Both modifications were detected only in tRNA. Further analysis revealed that tRNAs are present in form of 3’ and 5’ fragments and they are packed selectively. Moreover, these tRNAs are typically packed by other viruses. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | human Rhinovirus type 2;human Echovirus 18;LC-MS |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://doi.org/10.1002/cbic.202200281 |
| DOI výsledku | 10.1002/cbic.202200281 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/text-search?query=PRJEB53666 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Chembiochem |
|---|---|
| ISSN | 1439-4227 |
| e-ISSN | 1439-7633 |
| Svazek periodika | 23 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 17 |
| Stát vydavatele periodika | DE - Spolková republika Německo |
| Počet stran výsledku | 9 |
| Strana od-do | e202200281 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000828265300001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85134532067 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2023 |
| Specifikace | RIV/68378050:_____/22:00559536!RIV23-MSM-68378050 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 17.05.2023 |
| Kontrolní číslo | 192457904 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno AV ČR v roce 2023 | RIV/68378050:_____/22:00559536 v dodávce dat RIV23-AV0-68378050 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2023 | RIV/61388963:_____/22:00559536 v dodávce dat RIV23-AV0-61388963 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/60076658:12310/22:43904907 v dodávce dat RIV23-MSM-12310___ předkladatelem Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/00216224:14740/22:00128475 v dodávce dat RIV23-MSM-14740___ předkladatelem Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/00216208:11110/22:10445458 v dodávce dat RIV23-MSM-11110___ předkladatelem Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/61388963:_____/22:00559536 v dodávce dat RIV23-MSM-61388963 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/60461373:22310/22:43925547 v dodávce dat RIV23-MSM-22310___ předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemické technologie |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
|---|