Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/68378050:_____/22:00559438 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Genomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10606 - Microbiology |
| Rok uplatnění | 2022 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 7 |
| Počet tvůrců celkem | 10 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jakub Rídl (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5926971) Hynek Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3105849, researcherid: B-7361-2008) M. Desmarais (státní příslušnost: CZ - Česká republika) I. Dolinová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) S. Fraraccio (státní příslušnost: CZ - Česká republika) H. Kubátová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Strejček (státní příslušnost: CZ - Česká republika) A. Ševců (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Šuman (státní příslušnost: CZ - Česká republika) O. Uhlík (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Halogenated organic compounds are naturally occurring in subsurface environments, however, accumulation of the degradative intermediate cis-1,2-dichloroethene (cDCE) at soil and groundwater sites contaminated with xenobiotic chlorinated ethenes is a global environmental and public health issue. Identifying microorganisms capable of cDCE degradation in these environments is of interest because of their potential application to bioremediation techniques. In this study, we sequenced, assembled, and analyzed the complete genome of Acinetobacter pittii CEP14, a strain isolated from chloroethene-contaminated groundwater, that has demonstrated the ability for aerobic cometabolic degradation of cDCE in the presence of n-hexane, phenol, and toluene. The A. pittii CEP14 genome consists of a 3.93 Mbp-long chromosome (GenBank accession no. CP084921) with a GC content of 38.9% and three plasmids (GenBank accession no. CP084922, CP084923, and CP084924). Gene function was assigned to 83.4% of the 3,930 coding DNA sequences. Functional annotation of the genome revealed that the CEP14 strain possessed all genetic elements to mediate the degradation of a range of aliphatic and aromatic compounds, including n-hexane and phenol. In addition, it harbors gene clusters involved in cytosol detoxification and oxidative stress resistance, which could play a role in the mitigation of toxic chemical intermediates that can arise during the degradation of cDCE. Gene clusters for heavy metal and antibiotic resistance were also identified in the genome of CEP14. These results suggest that CEP14 may be a versatile degrader of xenobiotic compounds and well-adapted to polluted environments, where a combination of heavy metal and organic compound pollution is often found. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Acinetobacter pittii;Chlorinated ethenes (CEs);cis-1;2-dichloroethene (cDCE) biodegradation;Cometabolism;Whole-genome shotgun sequencing;Oxygenase;Phenol |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://link.springer.com/article/10.1007/s10482-022-01752-6 |
| DOI výsledku | 10.1007/s10482-022-01752-6 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology |
|---|---|
| ISSN | 0003-6072 |
| e-ISSN | 1572-9699 |
| Svazek periodika | 115 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 8 |
| Stát vydavatele periodika | NL - Nizozemsko |
| Počet stran výsledku | 17 |
| Strana od-do | 1041-1057 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000810824300001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | C - Omezený přístup (Restricted Access) |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2023 |
| Specifikace | RIV/68378050:_____/22:00559438!RIV23-MSM-68378050 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 17.05.2023 |
| Kontrolní číslo | 192457902 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno AV ČR v roce 2023 | RIV/68378050:_____/22:00559438 v dodávce dat RIV23-AV0-68378050 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno GA ČR v roce 2023 | RIV/46747885:24620/22:00009839 v dodávce dat RIV23-GA0-24620___ předkladatelem Technická univerzita v Liberci / Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2023 | RIV/60461373:22320/22:43924315 v dodávce dat RIV23-GA0-22320___ předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta technologie ochrany prostředí |
| Dodáno GA ČR v roce 2023 | RIV/60461373:22330/22:43924315 v dodávce dat RIV23-GA0-22330___ předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/60461373:22320/22:43924315 v dodávce dat RIV23-MSM-22320___ předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta technologie ochrany prostředí |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/60461373:22330/22:43924315 v dodávce dat RIV23-MSM-22330___ předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
|---|