Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníLetter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains (2021)výskyt výsledku

Identifikační kód	RIV/68081707:_____/21:00555649
Název v anglickém jazyce	Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk	eng - angličtina
Vědní obor	10608 - Biochemistry and molecular biology
Rok uplatnění	2021
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	5
Počet tvůrců celkem	8
Počet domácích tvůrců	3
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců	Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5700612, orcid: 0000-0003-2837-4226, researcherid: F-9582-2011) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373, orcid: 0000-0003-1854-6506, researcherid: D-6971-2012) Pratik Goswami (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5058905) M. Bartas (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Cerven (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Lexa (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Pečinka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) A. Volna (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce	In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.
Klíčová slova oddělená středníkem	SARS-CoV-2;mutations;inverted repeats
Stránka www, na které se nachází výsledek	https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140
DOI výsledku	https://doi.org/10.1093/bib/bbab129
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	Briefings in Bioinformatics
ISSN	1467-5463
e-ISSN	1477-4054
Svazek periodika	22
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	5
Stát vydavatele periodika	GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku	2
Strana od-do	bbab129
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000709461800149
EID výsledku v databázi Scopus	2-s2.0-85116173294
Způsob publikování výsledku	A - Open Access
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	-

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel	Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodavatel	MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
Rok sběru	2022
Specifikace	RIV/68081707:_____/21:00555649!RIV22-MSM-68081707
Datum poslední aktualizace výsledku	27.04.2022
Kontrolní číslo	192334482 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno AV ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707
Dodáno GA ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-GA0-68081707

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli

Dodáno GA ČR v roce 2022	RIV/61988987:17310/21:A2202CPW v dodávce dat RIV22-GA0-17310___ předkladatelem Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Dodáno MŠMT v roce 2022	RIV/00216224:14310/21:00121296 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný MŠMT v programu EF	EF15_003/0000477 - Strukturní gymnastika nukleových kyselin: od molekulárních principů přes biologické funkce k terapeutickým cílům. (2016 - 2022)