Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Rejstřík informací o výsledcích

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníLetter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains (2021)výskyt výsledku

Identifikační kód RIV/68081707:_____/21:00555649
Název v anglickém jazyce Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Druh J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk eng - angličtina
Vědní obor 10608 - Biochemistry and molecular biology
Rok uplatnění 2021
Kód důvěrnosti údajů S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku 5
Počet tvůrců celkem 8
Počet domácích tvůrců 3
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5700612, orcid: 0000-0003-2837-4226, researcherid: F-9582-2011)
Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373, orcid: 0000-0003-1854-6506, researcherid: D-6971-2012)
Pratik Goswami (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5058905)
M. Bartas (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
J. Cerven (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
M. Lexa (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
P. Pečinka (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
A. Volna (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.
Klíčová slova oddělená středníkem SARS-CoV-2;mutations;inverted repeats
Stránka www, na které se nachází výsledek https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140
DOI výsledku https://doi.org/10.1093/bib/bbab129
Odkaz na údaje z výzkumu -

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika Briefings in Bioinformatics
ISSN 1467-5463
e-ISSN 1477-4054
Svazek periodika 22
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku 5
Stát vydavatele periodika GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku 2
Strana od-do bbab129
Kód UT WoS článku podle Web of Science 000709461800149
EID výsledku v databázi Scopus 2-s2.0-85116173294
Způsob publikování výsledku A - Open Access
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku -

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodavatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru 2022
Specifikace RIV/68081707:_____/21:00555649!RIV22-GA0-68081707
Datum poslední aktualizace výsledku 04.05.2022
Kontrolní číslo 192356747 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno MŠMT v roce 2022 RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-MSM-68081707
Dodáno AV ČR v roce 2022 RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli

Dodáno GA ČR v roce 2022 RIV/61988987:17310/21:A2202CPW v dodávce dat RIV22-GA0-17310___ předkladatelem Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Dodáno MŠMT v roce 2022 RIV/00216224:14310/21:00121296 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný GA ČR v programu GA GA18-15548S - Srovnávací studie DNA interakčních vlastností izoforem nádorového supresoru proteinu p53 (2018 - 2020)
Vyhledávání ...