Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníTracing dsDNA Virus-Host Coevolution through Correlation of Their G-Quadruplex-Forming Sequences (2021)detail výsledku

Identifikační kód	RIV/68081707:_____/21:00542171
Název v anglickém jazyce	Tracing dsDNA Virus-Host Coevolution through Correlation of Their G-Quadruplex-Forming Sequences
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk	eng - angličtina
Vědní obor	10608 - Biochemistry and molecular biology
Rok uplatnění	2021
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	5
Popis výsledku v anglickém jazyce	The importance of gene expression regulation in viruses based upon G-quadruplex may point to its potential utilization in therapeutic targeting. Here, we present analyses as to the occurrence of putative G-quadruplex-forming sequences (PQS) in all reference viral dsDNA genomes and evaluate their dependence on PQS occurrence in host organisms using the G4Hunter tool. PQS frequencies differ across host taxa without regard to GC content. The overlay of PQS with annotated regions reveals the localization of PQS in specific regions. While abundance in some, such as repeat regions, is shared by all groups, others are unique. There is abundance within introns of Eukaryota-infecting viruses, but depletion of PQS in introns of bacteria-infecting viruses. We reveal a significant positive correlation between PQS frequencies in dsDNA viruses and corresponding hosts from archaea, bacteria, and eukaryotes. A strong relationship between PQS in a virus and its host indicates their close coevolution and evolutionarily reciprocal mimicking of genome organization.
Klíčová slova oddělená středníkem	G-quadruplex;virus;bioinformatics;coevolution;host;dsDNA;G4Hunter
Stránka www, na které se nachází výsledek	https://www.mdpi.com/1422-0067/22/7/3433
DOI výsledku	https://doi.org/10.3390/ijms22073433
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	International Journal of Molecular Sciences
ISSN	1422-0067
e-ISSN	1422-0067
Svazek periodika	22
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	7
Stát vydavatele periodika	CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku	12
Strana od-do	3433
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000638616100001
EID výsledku v databázi Scopus	2-s2.0-85103058094
Způsob publikování výsledku	A - Open Access
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	-

Informace o všech výskytech výsledku v rámci detailu výsledku

Dodáno MŠMT v roce 2021	RIV/00216305:26210/21:PU140956 v dodávce dat RIV21-MSM-26210___ předkladatelem Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství
Dodáno AV ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00542171 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno GA ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00542171 v dodávce dat RIV22-GA0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno MŠMT v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00542171 v dodávce dat RIV22-MSM-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno MŠMT v roce 2022	RIV/00216224:14310/21:00121350 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný MŠMT v programu EF	EF15_003/0000477 - Strukturní gymnastika nukleových kyselin: od molekulárních principů přes biologické funkce k terapeutickým cílům. (2016 - 2022)
Projekt podporovaný GA ČR v programu GA	GA18-15548S - Srovnávací studie DNA interakčních vlastností izoforem nádorového supresoru proteinu p53 (2018 - 2020)
Podpora / návaznosti	Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace