Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/21:00541909 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | G-quadruplexes in H1N1 influenza genomes |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 8 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Martin Bartas (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6768135) Natalia Bohalova (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9799949, orcid: 0000-0003-3898-7229) Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5700612, orcid: 0000-0003-2837-4226, researcherid: F-9582-2011) Alessio Cantara (státní příslušnost: IT - Italská republika, domácí tvůrce: A) Jan Coufal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7450346, orcid: 0000-0002-4102-8734) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373, orcid: 0000-0003-1854-6506, researcherid: D-6971-2012) Jean-Louis Mergny (státní příslušnost: FR - Francouzská republika, domácí tvůrce: A, orcid: 0000-0003-3043-8401) Otilia Porubiakova (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1956616) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | BackgroundInfluenza viruses are dangerous pathogens. Seventy-Seven genomes of recently emerged genotype 4 reassortant Eurasian avian-like H1N1 virus (G4-EA-H1N1) are currently available. We investigated the presence and variation of potential G-quadruplex forming sequences (PQS), which can serve as targets for antiviral treatment.ResultsPQS were identified in all 77 genomes. The total number of PQS in G4-EA-H1N1 genomes was 571. Interestingly, the number of PQS per genome in individual close relative viruses varied from 4 to 12. PQS were not randomly distributed in the 8 segments of the G4-EA-H1N1 genome, the highest frequency of PQS being found in the NP segment (1.39 per 1000nt), which is considered a potential target for antiviral therapy. In contrast, no PQS was found in the NS segment. Analyses of variability pointed the importance of some PQS, even if genome variation of influenza virus is extreme, the PQS with the highest G4Hunter score is the most conserved in all tested genomes. G-quadruplex formation in vitro was experimentally confirmed using spectroscopic methods.ConclusionsThe results presented here hint several G-quadruplex-forming sequences in G4-EA-H1N1 genomes, that could provide good therapeutic targets. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Influenza virus;G-quadruplex;G4Hunter |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-021-07377-9 |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1186/s12864-021-07377-9 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | BMC Genomics |
|---|---|
| ISSN | 1471-2164 |
| e-ISSN | 1471-2164 |
| Svazek periodika | 22 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 1 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 77 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000613379300001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85099932787 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/21:00541909!RIV22-MSM-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 27.04.2022 |
| Kontrolní číslo | 192334457 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno AV ČR v roce 2022 | RIV/68081707:_____/21:00541909 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2021 | RIV/00216305:26310/21:PU138597 v dodávce dat RIV21-MSM-26310___/05:1 předkladatelem Vysoké učení technické v Brně / Fakulta chemická |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/00216224:14310/21:00121026 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/61988987:17310/21:A22029NU v dodávce dat RIV22-MSM-17310___ předkladatelem Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EF | EF15_003/0000477 - Strukturní gymnastika nukleových kyselin: od molekulárních principů přes biologické funkce k terapeutickým cílům. (2016 - 2022) |
|---|