| Identifikační kód |
RIV/68081707:_____/18:00502202 |
| Název v anglickém jazyce |
Electrochemical Detection of SNP in Human Mitochondrial DNA Using Cyclic Primer Extension with Biotinylated Nucletides and Enzymatic Labeling at Disposable Pencil Graphite Electrodes |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis) |
| Rok uplatnění |
2018 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
4 |
| Počet domácích tvůrců |
2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373, researcherid: D-6971-2012)
Medard Plucnara (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6390005)
E. Eksin (státní příslušnost: TR - Turecká republika)
A. Erdem (státní příslušnost: TR - Turecká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
A novel method of SNP typing in human mitochondrial DNA utilizing enzymatic labeling and electrochemical detection at disposable pencil graphite electrodes is described. The procedure is based on amplification of DNA stretches by cyclic primer extension (PEx) of SNP-specific diagnostic primers in a mixture of biotinylated and natural nucleotides. The diagnostic primers are designed to recognize, by its 3'-terminal nucleotide, the SNP-site in target template. Under optimized conditions of the PEx reaction, efficient polymerase synthesis of biotin-labeled strands takes place only in the case of full complementarity between the diagnostic primer and the target SNP site. There is also benefit from introducing many biotin molecules per extended DNA strand, resulting in another level of signal amplification. After adsorption of biotinylated PEx products at the electrode surface, streptavidin-alkaline phosphatase conjugate was bound to the biotin tags, 1-naphthol was enzymatically produced and electrochemically detected. Several critical steps and parameters of the assay, including termination of 3'-OH ends of residual amplification primers, temperature for annealing of diagnostic primers, relative amount of biotinylated deoxynucleoside triphosphate in the PEx mixture and number of PEx cycles were optimized in this study to attain best SNP resolution, and reduction of time needed for the analysis. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
single-nucleotide polymorphisms;triplet repeat expansion;voltammetric detection;mutation |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| DOI výsledku |
10.1002/elan.201800314 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |