Zpět na hledáníIFI16 Preferentially Binds to DNA with Quadruplex Structure and Enhances DNA Quadruplex Formation (2016)detail výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/16:00462078 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | IFI16 Preferentially Binds to DNA with Quadruplex Structure and Enhances DNA Quadruplex Formation |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2016 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 6 |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | nterferon-inducible protein 16 (IFI16) is a member of the HIN-200 protein family, containing two HIN domains and one PYRIN domain. IFI16 acts as a sensor of viral and bacterial DNA and is important for innate immune responses. IFI16 binds DNA and binding has been described to be DNA length-dependent, but a preference for supercoiled DNA has also been demonstrated. Here we report a specific preference of IFI16 for binding to quadruplex DNA compared to other DNA structures. IFI16 binds to quadruplex DNA with significantly higher affinity than to the same sequence in double stranded DNA. By circular dichroism (CD) spectroscopy we also demonstrated the ability of IFI16 to stabilize quadruplex structures with quadruplex-forming oligonucleotides derived from human telomere (HTEL) sequences and the MYC promotor. A novel H/D exchange mass spectrometry approach was developed to assess protein interactions with quadruplex DNA. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | INTERFERON-INDUCIBLE PROTEIN;CIRCULAR-DICHROISM SPECTROSCOPY;RELEVANT G-QUADRUPLEX |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0157156 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | PLoS ONE |
|---|---|
| ISSN | 1932-6203 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 11 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 6 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 19 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000377563000097 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Informace o všech výskytech výsledku v rámci detailu výsledku
| Dodáno AV ČR v roce 2017 | RIV/68081707:_____/16:00462078 v dodávce dat RIV17-AV0-68081707/01:2 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2017 | RIV/68081707:_____/16:00462078 v dodávce dat RIV17-GA0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno GA ČR v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-GA0-00209805/02:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno MŠMT v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-MSM-00209805/02:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno MZ v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-MZ0-00209805/05:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno GA ČR v roce 2020 | RIV/00216224:14310/16:00107876 v dodávce dat RIV20-GA0-14310___/01:5 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GA15-21855S - Vliv konformačních motivů a epigenetických modifikací na DNA vazebné vlastnosti proteinů rodiny p53 (2015 - 2017) |
|---|---|
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GB | GBP206/12/G151 - Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice (2012 - 2018) |
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |