Zpět na hledáníIFI16 Preferentially Binds to DNA with Quadruplex Structure and Enhances DNA Quadruplex Formation (2016)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/16:00462078 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | IFI16 Preferentially Binds to DNA with Quadruplex Structure and Enhances DNA Quadruplex Formation |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2016 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 6 |
| Počet tvůrců celkem | 9 |
| Počet domácích tvůrců | 6 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5700612) Jan Coufal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7450346) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373) Lucia Haroniková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8978107) Eva Jagelská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4516664) Iva Kejnovská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7624352) P. Dvořáková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Muller (státní příslušnost: CZ - Česká republika) B. Vojtešek (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | nterferon-inducible protein 16 (IFI16) is a member of the HIN-200 protein family, containing two HIN domains and one PYRIN domain. IFI16 acts as a sensor of viral and bacterial DNA and is important for innate immune responses. IFI16 binds DNA and binding has been described to be DNA length-dependent, but a preference for supercoiled DNA has also been demonstrated. Here we report a specific preference of IFI16 for binding to quadruplex DNA compared to other DNA structures. IFI16 binds to quadruplex DNA with significantly higher affinity than to the same sequence in double stranded DNA. By circular dichroism (CD) spectroscopy we also demonstrated the ability of IFI16 to stabilize quadruplex structures with quadruplex-forming oligonucleotides derived from human telomere (HTEL) sequences and the MYC promotor. A novel H/D exchange mass spectrometry approach was developed to assess protein interactions with quadruplex DNA. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | INTERFERON-INDUCIBLE PROTEIN;CIRCULAR-DICHROISM SPECTROSCOPY;RELEVANT G-QUADRUPLEX |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0157156 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | PLoS ONE |
|---|---|
| ISSN | 1932-6203 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 11 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 6 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 19 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000377563000097 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2017 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/16:00462078!RIV17-AV0-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 05.05.2017 |
| Kontrolní číslo | 191868199 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2017 | RIV/68081707:_____/16:00462078 v dodávce dat RIV17-GA0-68081707/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno GA ČR v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-GA0-00209805/02:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-MSM-00209805/02:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno MZ v roce 2017 | RIV/00209805:_____/16:N0000037 v dodávce dat RIV17-MZ0-00209805/05:1 předkladatelem Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno GA ČR v roce 2020 | RIV/00216224:14310/16:00107876 v dodávce dat RIV20-GA0-14310___/01:5 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|