Identifikační kód |
RIV/68081707:_____/13:00394804 |
Název v anglickém jazyce |
Dancing together and separate again: gymnosperms exhibit frequent changes of fundamental 5S and 35S rRNA gene (rDNA) organisation |
Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
Poddruh |
- |
Jazyk |
eng - angličtina |
Obor - skupina |
B - Fyzika a matematika |
Obor |
BO - Biofyzika |
Rok uplatnění |
2013 |
Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku |
2 |
Počet tvůrců celkem |
2 |
Počet domácích tvůrců |
1 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Aleš Kovařík (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9701125) S. Garcia (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
Popis výsledku v anglickém jazyce |
In higher eukaryotes, the 5S rRNA genes occur in tandem units and are arranged either separately (S-type arrangement) or linked to other repeated genes, in most cases to rDNA locus encoding 18S-5.8S-26S genes (L-type arrangement). Here we used Southern blot hybridisation, PCR and sequencing approaches to analyse genomic organisation of rRNA genes in all large gymnosperm groups, including Coniferales, Ginkgoales, Gnetales and Cycadales. The data are provided for 27 species (21 genera). The 5S units linked to the 35S rDNA units occur in some but not all Gnetales, Coniferales and in Ginkgo (similar to 30% of the species analysed), while the remaining exhibit separate organisation. The linked 5S rRNA genes may occur as single-copy insertions or as short tandems embedded in the 26S-18S rDNA intergenic spacer (IGS). The 5S transcript may be encoded by the same (Ginkgo, Ephedra) or opposite (Podocarpus) DNA strand as the 18S-5.8S-26S genes. In addition, pseudogenised 5S copies were also found |
Klíčová slova oddělená středníkem |
rRNA gene organisation; intergenic spacer; Ginkgo |
Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
DOI výsledku |
10.1038/hdy.2013.11 |
Odkaz na údaje z výzkumu |
- |