Zpět na hledáníElbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/09:00331241 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 3 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) J. Curuksu (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) M. Zacharias (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Umbrella-sampling molecular dynamics simulations were used to disrupt an A-minor interaction in the ribosomal kt38 turn and to calculate the associated free-energy change. The simulations revealed a coupled A-minor disruption and global opening of the K-turn motif, and allowed us to characterize several intermediate A-minor conformations. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | umbrella-sampling; molecular dynamics; A-minor interaction |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Biophysical Journal |
|---|---|
| ISSN | 0006-3495 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 97 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 7 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 10 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000270586000023 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/09:00331241!RIV10-AV0-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 26.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 12238520 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný AV ČR v programu IA | IAA400040802 - Struktura, dynamika a reakční mechanismus katalytické RNA (2008 - 2011) |
|---|---|
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040507 - Biofyzika dynamických struktur a funkcí biologických systémů (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007 - 2013) |