Zpět na hledáníTrans Hoogsteen/sugar edge base pairing in RNA. Structures, energies, and stabilities from quantum chemical calculations (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/09:00322991 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Trans Hoogsteen/sugar edge base pairing in RNA. Structures, energies, and stabilities from quantum chemical calculations |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Arnošt Mládek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9739807) Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) Judit E. Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5279909) D. Bhattacharyya (státní příslušnost: IN - Indická republika) A. Mitra (státní příslušnost: IN - Indická republika) P. SHARMA (státní příslušnost: IN - Indická republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Trans Hoogsteen/sugar edge (H/SE) RNA base pairs form one of the six families of RNA base pairs that utilize the 2'-hydroxyl group of ribose for base pairing and play key roles in stabilizing folded RNA molecules. Here we provide a detailed quantum chemical characterization of intrinsic structures and interaction energies of this base pair family, along with the evaluation of solvent screening effects by a continuum solvent approach. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | quantum chemical calculations; base pairing; RNA |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Physical Chemistry B |
|---|---|
| ISSN | 1520-6106 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 113 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 6 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 13 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000263134500025 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2009 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/09:00322991!RIV09-AV0-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 20.08.2009 |
| Kontrolní číslo | 11589401 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2009 | RIV/68081707:_____/09:00322991 v dodávce dat RIV09-MSM-68081707/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/00216224:14310/09:00036461 v dodávce dat RIV10-MSM-14310___/02:2 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný AV ČR v programu 1Q | 1QS500040581 - Metalofarmaka, vývoj a mechanismus působení (2005 - 2009) |
|---|---|
| Projekt podporovaný AV ČR v programu IA | IAA400040802 - Struktura, dynamika a reakční mechanismus katalytické RNA (2008 - 2011) |
| Projekt podporovaný AV ČR v programu IA | IAA400550701 - Structure and dynamics in complexes of solvated biomolecules (2007 - 2009) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z40550506 - Regulace biologických procesů: Chemické modulátory vybraných systémů významných pro medicínu a zemědělství (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040507 - Biofyzika dynamických struktur a funkcí biologických systémů (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007 - 2013) |