| Identifikační kód |
RIV/68081707:_____/07:00081633 |
| Název v anglickém jazyce |
Impact of an extruded nucleotide on cleavage activity and dynamic catalytic core conformation of the hepatitis delta virus ribozyme |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
B - Fyzika a matematika |
| Obor |
BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění |
2007 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
3 |
| Počet tvůrců celkem |
5 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Maryna V. Krasovská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6222684)
Naděžda Špačková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7167830)
Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779)
J. Šefčíková (státní příslušnost: US - Spojené státy americké)
N. G. Walter (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
The self-cleaving hepatitis delta virus (HDV) ribozyme is essential for the replication of HDV, a liver disease causing pathogen in humans. The catalytically critical nucleotide C75 of the ribozyme is buttressed by a trefoil turn pivoting around an extruded G76. In all available crystal structures, the conformation of G76 is restricted by stacking with G76 of a neighboring molecule. To test whether this crystal contact introduces a structural perturbation into a catalytic core, we have analyzed ~200 nsof molecular dynamics simulations. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
conformational dynamics; hepatitis delta virus; molecular dynamics |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |