Zpět na hledáníCations and hydration in catalytic RNA: Molecular dynamics of the hepatitis delta virus ribozyme (2006)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/68081707:_____/06:00040367 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Cations and hydration in catalytic RNA: Molecular dynamics of the hepatitis delta virus ribozyme |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2006 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 6 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Maryna V. Krasovská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6222684) Kamila Réblová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9031510) Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3223779) Bohdan Schneider (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5185599) J. Šefčíková (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) N. G. Walter (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Cations play a crucial role in self-cleavage of the HDV ribozyme, by promoting both folding and chemistry. Here, we analyzed a total of ~200 ns of explicit-solvent molecular dynamics simulations to provide a complementary atomistic view of the binding ofmonovalent and divalent cations as well as water molecules to reaction precursor and product forms of the HDV ribozyme. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | molecular dynamics; cations; hydration |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Biophysical Journal |
|---|---|
| ISSN | 0006-3495 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 91 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 2 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 13 |
| Strana od-do | 626-638 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2007 |
| Specifikace | RIV/68081707:_____/06:00040367!RIV07-AV0-68081707 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 05.09.2008 |
| Kontrolní číslo | 10520840 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2007 | RIV/68081707:_____/06:00040367 v dodávce dat RIV07-GA0-68081707/02:2 |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2007 | RIV/68081707:_____/06:00040367 v dodávce dat RIV07-MSM-68081707/01:1 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2007 | RIV/00216224:14310/06:00016974 v dodávce dat RIV07-MSM-14310___/01:1 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2008 | RIV/00216224:14310/06:00016974 v dodávce dat RIV08-MSM-14310___/02:2 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/00216224:14310/06:00016974 v dodávce dat RIV10-MSM-14310___/02:2 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný AV ČR v programu 1Q | 1QS500040581 - Metalofarmaka, vývoj a mechanismus působení (2005 - 2009) |
|---|---|
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z40550506 - Regulace biologických procesů: Chemické modulátory vybraných systémů významných pro medicínu a zemědělství (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040507 - Biofyzika dynamických struktur a funkcí biologických systémů (2005 - 2010) |