| Identifikační kód |
RIV/61989592:15310/14:33152310 |
| Název v anglickém jazyce |
Amphiphilic Drug-like Molecules Accumulate in A Membrane Below the Head Group Region |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
C - Chemie |
| Obor |
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Rok uplatnění |
2014 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
5 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Karel Berka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4936094)
Michal Otyepka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3151948)
Markéta Paloncýová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1410695)
Russell Devane (státní příslušnost: US - Spojené státy americké)
Bruce Murch (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
The partitioning behavior of drug-like molecules into biomembranes has a crucial impact on the design and efficacy of therapeutic drugs. Thermodynamic properties connected with the interaction of molecules with membranes can be evaluated by calculating free-energy profiles normal to the membrane surface. We calculated the free-energy profiles of 25 drug-like molecules in a 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) membrane and free energies of solvation in water and heptane using two methods, molecular dynamics (MD) simulations with the Berger lipid force field and COSMOmic, based on a continuum conductor-like screening model for realistic solvation (COSMO-RS). The biased MD simulations (in total ?22 mýs long) were relatively computationally expensive, whereas the COSMOmic approach offered a significantly less expensive alternative. Both methods provided similar results and showed that the studied amphiphilic drug-like molecules accumulate in the membrane, with the majority local |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
peroxidation; approximation; behavior; water; permeation; COSMO-RS; force-field; dynamics simulations; partition-coefficients; lipid-bilayer |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp4112052 |
| DOI výsledku |
10.1021/jp4112052 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |