Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníLetter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains (2021)výskyt výsledku

Identifikační kód	RIV/61988987:17310/21:A2202CPW
Název v anglickém jazyce	Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk	eng - angličtina
Vědní obor	10607 - Virology
Rok uplatnění	2021
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	5
Počet tvůrců celkem	6
Počet domácích tvůrců	4
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců	Martin Bartas (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6768135, orcid: 0000-0002-4415-2220, scopusid: 57201406851, researcherid: P-3302-2018) Jiří Červeň (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6775365, orcid: 0000-0002-1893-8270) Petr Pečinka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3787125) Adriana Volná (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8784784) Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce	In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides. However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool, we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.
Klíčová slova oddělená středníkem	SARS-CoV-2;inverted repeats;mutations
Stránka www, na které se nachází výsledek	https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140?login=true
DOI výsledku	https://doi.org/10.1093/bib/bbab129
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	BRIEF BIOINFORM
ISSN	1467-5463
e-ISSN	1477-4054
Svazek periodika	22
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	5
Stát vydavatele periodika	GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku	2
Strana od-do	1-2
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000709461800149
EID výsledku v databázi Scopus	-
Způsob publikování výsledku	B - Open Access s časovým embargem (Embargoed Access)
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	05.09.2021

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel	Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Dodavatel	GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru	2022
Specifikace	RIV/61988987:17310/21:A2202CPW!RIV22-GA0-17310___
Datum poslední aktualizace výsledku	04.05.2022
Kontrolní číslo	192358802 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli

Dodáno AV ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno GA ČR v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-GA0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno MŠMT v roce 2022	RIV/68081707:_____/21:00555649 v dodávce dat RIV22-MSM-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Dodáno MŠMT v roce 2022	RIV/00216224:14310/21:00121296 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný GA ČR v programu GA	GA18-18699S - Nestandardní genetické kódy protistů a jejich evoluce (2018 - 2020)