Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/61988987:17310/21:A22029NU |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | G-quadruplexes in H1N1 influenza genomes |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10607 - Virology |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Martin Bartas (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6768135, orcid: 0000-0002-4415-2220, scopusid: 57201406851, researcherid: P-3302-2018) Natália Bohálová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Václav Brázda (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Allesio Cantara (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Jan Coufal (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Jean Louis Mergny (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Otília Porubiaková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Background Influenza viruses are dangerous pathogens. Seventy-Seven genomes of recently emerged genotype 4 reassortant Eurasian avian-like H1N1 virus (G4-EA-H1N1) are currently available. We investigated the presence and variation of potential G-quadruplex forming sequences (PQS), which can serve as targets for antiviral treatment. Results PQS were identified in all 77 genomes. The total number of PQS in G4-EA-H1N1 genomes was 571. Interestingly, the number of PQS per genome in individual close relative viruses varied from 4 to 12. PQS were not randomly distributed in the 8 segments of the G4-EA-H1N1 genome, the highest frequency of PQS being found in the NP segment (1.39 per 1000 nt), which is considered a potential target for antiviral therapy. In contrast, no PQS was found in the NS segment. Analyses of variability pointed the importance of some PQS; even if genome variation of influenza virus is extreme, the PQS with the highest G4Hunter score is the most conserved in all tested genomes. G-quadruplex formation in vitro was experimentally confirmed using spectroscopic methods. Conclusions The results presented here hint several G-quadruplex-forming sequences in G4-EA-H1N1 genomes, that could provide good therapeutic targets. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | influenza;H1N1;G-quadruplex |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-021-07377-9 |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1186/s12864-021-07377-9 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | BMC Genomics |
|---|---|
| ISSN | 1471-2164 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 22 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 77 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 1-11 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000613379300001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/61988987:17310/21:A22029NU!RIV22-MSM-17310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 28.04.2022 |
| Kontrolní číslo | 192335711 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2021 | RIV/00216305:26310/21:PU138597 v dodávce dat RIV21-MSM-26310___/05:1 předkladatelem Vysoké učení technické v Brně / Fakulta chemická |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2022 | RIV/68081707:_____/21:00541909 v dodávce dat RIV22-AV0-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/68081707:_____/21:00541909 v dodávce dat RIV22-MSM-68081707 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/00216224:14310/21:00121026 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___ předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |
|---|