Zpět na hledáníIntegration of Genetic and Cytogenetic Maps and Identification of Sex Chromosome in Garden Asparagus (Asparagus officinalis L.) (2018)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/61389030:_____/18:00493453 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Integration of Genetic and Cytogenetic Maps and Identification of Sex Chromosome in Garden Asparagus (Asparagus officinalis L.) |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) |
| Rok uplatnění | 2018 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 9 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Petr Cápal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9825622, orcid: 0000-0002-8888-9101, researcherid: F-7707-2014) Jaroslav Doležel (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1800477, orcid: 0000-0002-6263-0492, researcherid: B-7716-2008) Marie Kubaláková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5256593, researcherid: F-8269-2014) Jan Vrána (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9606599, orcid: 0000-0001-6171-8516, researcherid: F-7306-2014) P. Castro (státní příslušnost: ES - Španělské království) V. Garcia (státní příslušnost: ES - Španělské království) J. Gil (státní příslušnost: ES - Španělské království) T. Millán (státní příslušnost: ES - Španělské království) R. Moreno (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | A genetic linkage map of dioecious garden asparagus (Asparagus officinalis L., 2n = 2x = 20) was constructed using F-1 population, simple sequence repeat (SSR) and single nucleotide polymorphism (SNP) markers. In total, 1376 SNPs and 27 SSRs were used for genetic mapping. Two resulting parental maps contained 907 and 678 markers spanning 1947 and 1814 cM, for female and male parent, respectively, over ten linkage groups representing ten haploid chromosomes of the species. With the aim to anchor the ten genetic linkage groups to individual chromosomes and develop a tool to facilitate genome analysis and gene cloning, we have optimized a protocol for flow cytometric chromosome analysis and sorting in asparagus. The analysis of DAPI-stained suspensions of intact mitotic chromosomes by flow cytometry resulted in histograms of relative fluorescence intensity (flow karyotypes) comprising eight major peaks. The analysis of chromosome morphology and localization of 5S and 45S rDNA by FISH on flow-sorted chromosomes, revealed that four chromosomes (IV, V, VI, VIII) could be discriminated and sorted. Seventy-two SSR markers were used to characterize chromosome content of individual peaks on the flow karyotype. Out of them, 27 were included in the genetic linkage map and anchored genetic linkage groups to chromosomes. The sex determining locus was located on LG5, which was associated with peak V representing a chromosome with 5S rDNA locus. The results obtained in this study will support asparagus improvement by facilitating targeted marker development and gene isolation using flow-sorted chromosomes. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | flow-sorted chromosomes;microsatellite markers;plant chromosome;physical maps;linkage map;vicia-faba;genome;barley;locus;cytometry;Asparagus officinalis;sex chromosome;fish;flow-sorted chromosomes;SNPs;SSRs;genetic map |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.3389/fpls.2018.01068 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Frontiers in Plant Science |
|---|---|
| ISSN | 1664-462X |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 9 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | JUL 31 |
| Stát vydavatele periodika | CH - Švýcarská konfederace |
| Počet stran výsledku | 10 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000440277000001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85051867327 |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2019 |
| Specifikace | RIV/61389030:_____/18:00493453!RIV19-GA0-61389030 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 10.05.2019 |
| Kontrolní číslo | 192084027 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2019 | RIV/61389030:_____/18:00493453 v dodávce dat RIV19-MSM-61389030/01:1 |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2019 | RIV/61389030:_____/18:00493453 v dodávce dat RIV19-AV0-61389030/01:1 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GB | GBP501/12/G090 - Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin (2012 - 2018) |
|---|