| Identifikační kód |
RIV/61389030:_____/17:00482959 |
| Název v anglickém jazyce |
Transcriptome of barley under three different heavy metal stress reaction |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10611 - Plant sciences, botany |
| Rok uplatnění |
2017 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
4 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Nicolas Blavet (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8771332, researcherid: F-8148-2014)
Roman Hobza (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8725616, researcherid: G-3119-2014)
Martina Kintlová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4592705)
R. Cegan (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
In the present study, we used Illumina sequencing technology (HiSeq 2000) to sequence the transcriptome of barley (Hordeum vulgare L., cv. Morex) under three different heavy metal stress conditions: copper, zinc and cadmium. For each of those metals, the concentration causing a 50% inhibitory effect for root growth (EC50) was determined. We sequenced the total RNA of both roots and shoots from barley with and without heavy metal treatments in three replicates. Raw reads of the transcriptome project have been deposited in NCBI's BioProject accession number PRJNA382490. The obtained transcriptomic data will be useful for further studies focusing on heavy metal tolerance and comparative transcriptome analysis in barley. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
plants;Barley;RNA-Seq;Transcriptome;Heavy metal;Copper;Zinc;Cadmium |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| DOI výsledku |
10.1016/j.gdata.2017.05.016 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |