Zpět na hledáníHaplotype Analysis of the Pre-harvest Sprouting Resistance Locus Phs-A1 Reveals a Causal Role of TaMKK3-A in Global Germplasm (2017)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/61389030:_____/17:00479096 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Haplotype Analysis of the Pre-harvest Sprouting Resistance Locus Phs-A1 Reveals a Causal Role of TaMKK3-A in Global Germplasm |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10611 - Plant sciences, botany |
| Rok uplatnění | 2017 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 11 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Barbora Balcárková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4065158) Kateřina Holušová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1079425) Miroslav Valárik (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5373638, researcherid: F-6129-2014) R. A. Barrero (státní příslušnost: AU - Austrálie) A. Distelfeld (státní příslušnost: AU - Austrálie) M. J. Hayden (státní příslušnost: AU - Austrálie) J. Hyles (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) O. Shorinola (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) J. F. G. Tibbits (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) A. Torada (státní příslušnost: AU - Austrálie) C. Uauy (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Pre-harvest sprouting (PHS) is an important cause of quality loss in many cereal crops and is particularly prevalent and damaging in wheat. Resistance to PHS is therefore a valuable target trait in many breeding programs. The Phs-A1 locus on wheat chromosome arm 4AL has been consistently shown to account for a significant proportion of natural variation to PHS in diverse mapping populations. However, the deployment of sprouting resistance is confounded by the fact that different candidate genes, including the tandem duplicated Plasma Membrane 19 (PM19) genes and the mitogen-activated protein kinase kinase 3 (TaMKK3-A) gene, have been proposed to underlie Phs-A1. To further define the Phs-A1 locus, we constructed a physical map across this interval in hexaploid and tetraploid wheat. We established close proximity of the proposed candidate genes which are located within a 1.2 Mb interval. Genetic characterization of diverse germplasm used in previous genetic mapping studies suggests that TaMKK3-A, and not PM19, is the major gene underlying the Phs-A1 effect in European, North American, Australian and Asian germplasm. We identified the non-dormant TaMKK3-A allele at low frequencies within the A-genome diploid progenitor Triticum urartu genepool, and show an increase in the allele frequency in modern varieties. In United Kingdom varieties, the frequency of the dormant TaMKK3-A allele was significantly higher in bread-making quality varieties compared to feed and biscuit-making cultivars. Analysis of exome capture data from 58 diverse hexaploid wheat accessions identified fourteen haplotypes across the extended Phs-A1 locus and four haplotypes for TaMKK3-A. Analysis of these haplotypes in a collection of United Kingdom and Australian cultivars revealed distinct major dormant and non-dormant Phs-A1 haplotypes in each country, which were either rare or absent in the opposing germplasm set. The diagnostic markers and haplotype information reported in the study will help inform the choice of germplasm and breeding strategies for the deployment of Phs-A1 resistance into breeding germplasm. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | triticum-aestivum l.;controlling seed dormancy;white-grained wheat;pcr-based markers;chromosome 4a;winter-wheat;major qtl;abscisic-acid;bread wheat;genes;dormancy;seed;pm19;TaMKK3-A;pre-harvest sprouting;Triticum aestivum;haplotype |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.3389/fpls.2017.01555 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Frontiers in Plant Science |
|---|---|
| ISSN | 1664-462X |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 8 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | SEP 13 |
| Stát vydavatele periodika | CH - Švýcarská konfederace |
| Počet stran výsledku | 14 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000410486900001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2018 |
| Specifikace | RIV/61389030:_____/17:00479096!RIV18-GA0-61389030 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 26.04.2018 |
| Kontrolní číslo | 191964271 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno AV ČR v roce 2018 | RIV/61389030:_____/17:00479096 v dodávce dat RIV18-AV0-61389030/01:1 |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2018 | RIV/61389030:_____/17:00479096 v dodávce dat RIV18-MSM-61389030/01:1 |