Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/61388971:_____/20:00531246 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology |
| Rok uplatnění | 2020 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | In this paper, correlation analysis of protein and mRNA levels in the soil dwelling bacteriaStreptomyces coelicolor(S. coelicolorM145) is presented during development of the population as it grew in liquid medium using three biological and two technical replicates, measured during exponential growth, and its entry into the stationary phase. The proteome synthesis time series are compared with the gene expression time series measured previously under identical experimental conditions. Results reveal that about one third of protein/mRNA synthesis profiles are well correlated while another third are correlated negatively. Functional analysis of the highly correlated groups is presented. Based on numerical simulation, the negative correlation between protein and mRNA is shown to be caused by the difference between the rate of translation and protein degradation. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | computational modeling;mass spectrometry;mRNA |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/pmic.202000032 |
| DOI výsledku | 10.1002/pmic.202000032 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Proteomics |
|---|---|
| ISSN | 1615-9853 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 20 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 14 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 5 |
| Strana od-do | 2000032 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000543743200001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85087156886 |
| Způsob publikování výsledku | C - Omezený přístup (Restricted Access) |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Informace o všech výskytech výsledku v rámci detailu výsledku
| Dodáno AV ČR v roce 2021 | RIV/61388971:_____/20:00531246 v dodávce dat RIV21-AV0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2021 | RIV/61388963:_____/20:00531246 v dodávce dat RIV21-AV0-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2021 | RIV/61388971:_____/20:00531246 v dodávce dat RIV21-MSM-61388971/01:2 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2021 | RIV/61388963:_____/20:00531246 v dodávce dat RIV21-MSM-61388963/01:1 předkladatelem Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015047 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2016 - 2017) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015055 - Centrum pro systémovou biologii (2016 - 2017) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
| Velká výzkumná infrastruktura 90047 | ELIXIR-CZ ( kód: 90047, 2016 - 2019 ) |
| Velká výzkumná infrastruktura 90055 | C4SYS ( kód: 90055, 2016 - 2019 ) |
| Velká výzkumná infrastruktura 90131 | ELIXIR-CZ II ( kód: 90131, 2020 - 2022 ) |
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |