| Identifikační kód |
RIV/61388971:_____/20:00531246 |
| Název v anglickém jazyce |
A Comparison of Protein and mRNA Expression during Development of the Soil Dwelling Prokaryote (S. coelicolor) |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology |
| Rok uplatnění |
2020 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
5 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Jiří Pospíšil (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4742214)
Jiří Vohradský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7810342, researcherid: H-4121-2014)
Alice Ziková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9333738)
Martin Hubálek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0003-0247-7956, researcherid: H-1400-2014)
Dmytro Strunin (státní příslušnost: UA - Ukrajina) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
In this paper, correlation analysis of protein and mRNA levels in the soil dwelling bacteriaStreptomyces coelicolor(S. coelicolorM145) is presented during development of the population as it grew in liquid medium using three biological and two technical replicates, measured during exponential growth, and its entry into the stationary phase. The proteome synthesis time series are compared with the gene expression time series measured previously under identical experimental conditions. Results reveal that about one third of protein/mRNA synthesis profiles are well correlated while another third are correlated negatively. Functional analysis of the highly correlated groups is presented. Based on numerical simulation, the negative correlation between protein and mRNA is shown to be caused by the difference between the rate of translation and protein degradation. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
computational modeling;mass spectrometry;mRNA |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/pmic.202000032 |
| DOI výsledku |
10.1002/pmic.202000032 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |