Zpět na hledáníBalance of attraction and repulsion in nucleic-acid base stacking: CCSD(T)/complete-basis-set-limit calculations on uracil dimer and a comparison with the force-field description (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/61388963:_____/09:00326978 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Balance of attraction and repulsion in nucleic-acid base stacking: CCSD(T)/complete-basis-set-limit calculations on uracil dimer and a comparison with the force-field description |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 7 |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Pavel Hobza (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2932016) Petr Jurečka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3843912) C. A. Morgado (státní příslušnost: CL - Chilská republika) Daniel Svozil (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5520991) Jiří Šponer (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3223779) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We have carried out reference quantum-chemical calculations for about 100 geometries of the uracil dimer in stacked conformations. The calculations have been specifically aimed at geometries with unoptimized distances between the monomers. Apart form quantum-chemical calculations we have carried out calculations based molecular mechanics, as well. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | quantum chemical calculations; nucleic acids; force field |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Chemical Theory and Computation |
|---|---|
| ISSN | 1549-9618 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 5 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 6 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 21 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000266865000009 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/61388963:_____/09:00326978!RIV10-AV0-61388963 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 26.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 12163991 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/61388963:_____/09:00326978 v dodávce dat RIV10-MSM-61388963/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2010 | RIV/68081707:_____/09:00326978 v dodávce dat RIV10-AV0-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/68081707:_____/09:00326978 v dodávce dat RIV10-MSM-68081707/01:1 předkladatelem Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/00216224:14310/09:00036462 v dodávce dat RIV10-MSM-14310___/02:2 předkladatelem Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/61989592:15310/09:00010261 v dodávce dat RIV10-MSM-15310___/01:1 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2011 | RIV/60461373:22310/09:00021551 v dodávce dat RIV11-MSM-22310___/01:1 předkladatelem Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemické technologie |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný AV ČR v programu IA | IAA400040802 - Struktura, dynamika a reakční mechanismus katalytické RNA (2008 - 2011) |
|---|---|
| Projekt podporovaný AV ČR v programu IA | IAA400550701 - Structure and dynamics in complexes of solvated biomolecules (2007 - 2009) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z40550506 - Regulace biologických procesů: Chemické modulátory vybraných systémů významných pro medicínu a zemědělství (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040507 - Biofyzika dynamických struktur a funkcí biologických systémů (2005 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný AV ČR | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007 - 2013) |