Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/60461373:22330/22:43924317 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/B - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi SCOPUS společnosti Elsevier s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jsc) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10606 - Microbiology |
| Rok uplatnění | 2022 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 7 |
| Počet tvůrců celkem | 11 |
| Počet domácích tvůrců | 7 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Eva Benešová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3190439, orcid: 0000-0002-3696-3517) Petra Lipovová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4654730, orcid: 0000-0003-2275-3479, researcherid: Q-7187-2017) Michal Strejček (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5484464, orcid: 0000-0002-6755-5356) Jáchym Šuman (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2213990, orcid: 0000-0003-1828-8391, scopusid: 36651830300, researcherid: AAB-5244-2020) Ondřej Uhlík (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6537847, orcid: 0000-0002-0506-202X, scopusid: 24777271200, researcherid: D-3672-2010) Pavel Ulbrich (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6489419, orcid: 0000-0002-9076-8210, scopusid: 16067444700, researcherid: F-5747-2010) Patricie Vodičková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5673852, orcid: 0000-0002-2441-5038) T. Cajthaml (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Neumann-Schaal (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Pajer (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Ridl (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | An aerobic, Gram-stain-positive and non-spore-forming strain, designated C1-1T, was isolated from a fellfield soil sample collected from frost-sorted polygons on Jane Col, Signy Island, Maritime Antarctic. Cells with a size of 0.65–0.9×1.2–1.7 µm have a flagellar motile apparatus and exhibit a rod–coccus growth cycle. Optimal growth conditions were observed at 15–20 °C, pH 7.0 and NaCl concentration up to 0.5% (w/v) in the medium. The 16S rRNA gene sequence of C1-1T showed the highest pairwise similarity of 98.77% to Arthrobacter glacialis NBRC 113092T. Phylogenetic trees based on the 16S rRNA and whole-genome sequences revealed that strain C1-1T belongs to the genus Arthrobacter and is most closely related to members of the ‘Arthrobacter psychrolactophilus group’. The G+C content of genomic DNA was 58.95mol%. The original and orthologous average nucleotide identities between strain C1-1T and A. glacialis NBRC 113092T were 77.15% and 77.38%, respectively. The digital DNA–DNA relatedness values between strain C1-1T and A. glacialis NBRC 113092T was 21.6%. The polar lipid profile was composed mainly of diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylinositol and an unidentified glycolipid. The predominant cellular fatty acids were anteiso-C15:0 (75%) and anteiso-C17:0 (15.2%). Menaquinone MK-9(H2) (86.4%) was the major respiratory quinone in strain C1-1T. The peptidoglycan type was determined as A3α (l-Lys–l-Ala3; A11.6). Based on all described phylogenetic, physiological and chemotaxonomic characteristics, we propose that strain C1-1T (=DSM 112353T=CCM 9148T) is the type strain of a novel species Arthrobacter polaris sp. nov. © 2022 The Authors. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | whole-genome sequencing;Micrococcaceae;cold-adapted microorganisms;Arthrobacter;Antarctica |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.005541 |
| DOI výsledku | 10.1099/ijsem.0.005541 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |
|---|---|
| ISSN | 1466-5026 |
| e-ISSN | 1466-5034 |
| Svazek periodika | 72 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 10 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 10 |
| Strana od-do | nestrankovano |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85140168570 |
| Způsob publikování výsledku | C - Omezený přístup (Restricted Access) |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2023 |
| Specifikace | RIV/60461373:22330/22:43924317!RIV23-MSM-22330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 10.05.2023 |
| Kontrolní číslo | 192444955 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2023 | RIV/61388971:_____/22:00566474 v dodávce dat RIV23-AV0-61388971 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2023 | RIV/68378050:_____/22:00566474 v dodávce dat RIV23-AV0-68378050 předkladatelem Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MO v roce 2023 | RIV/60162694:G33__/22:N0000001 v dodávce dat RIV23-MO0-G33_____ předkladatelem Ministerstvo obrany / Vojenský zdravotní ústav Praha |
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/00216208:11310/22:10453742 v dodávce dat RIV23-MSM-11310___ předkladatelem Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2024 | RIV/61388971:_____/22:00566474 v dodávce dat RIV24-MSM-61388971 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2024 | RIV/68378050:_____/22:00566474 v dodávce dat RIV24-MSM-68378050 předkladatelem Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LT | LTAUSA19028 - Mikrobiomy vybraných extrémních biotopů – jejich fylogenetická diversita a funkční potenciál (2019 - 2022) |
| Podpora / návaznosti | Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |