Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGenomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene (2022)výskyt výsledku

Identifikační kód	RIV/60461373:22330/22:43924315
Název v anglickém jazyce	Genomic analysis of Acinetobacter pittii CEP14 reveals its extensive biodegradation capabilities, including cometabolic degradation of cis-1,2-dichloroethene
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk	eng - angličtina
Vědní obor	10606 - Microbiology
Rok uplatnění	2022
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	7
Počet tvůrců celkem	10
Počet domácích tvůrců	4
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců	Serena Fraraccio (státní příslušnost: IT - Italská republika, domácí tvůrce: A, orcid: 0000-0002-5097-8176) Michal Strejček (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5484464, orcid: 0000-0002-6755-5356) Jáchym Šuman (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2213990, orcid: 0000-0003-1828-8391, scopusid: 36651830300, researcherid: AAB-5244-2020) Ondřej Uhlík (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6537847, orcid: 0000-0002-0506-202X, scopusid: 24777271200, researcherid: D-3672-2010) Miguel Desmarais (státní příslušnost: CA - Kanada, orcid: 0000-0002-8240-8629) I. Dolinova (státní příslušnost: CZ - Česká republika) H. Kubatova (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Ridl (státní příslušnost: CZ - Česká republika) A. Sevcu (státní příslušnost: CZ - Česká republika) H. Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce	Halogenated organic compounds are naturally occurring in subsurface environments; however, accumulation of the degradative intermediate cis-1,2-dichloroethene (cDCE) at soil and groundwater sites contaminated with xenobiotic chlorinated ethenes is a global environmental and public health issue. Identifying microorganisms capable of cDCE degradation in these environments is of interest because of their potential application to bioremediation techniques. In this study, we sequenced, assembled, and analyzed the complete genome of Acinetobacter pittii CEP14, a strain isolated from chloroethene-contaminated groundwater, that has demonstrated the ability for aerobic cometabolic degradation of cDCE in the presence of n-hexane, phenol, and toluene. The A. pittii CEP14 genome consists of a 3.93 Mbp-long chromosome (GenBank accession no. CP084921) with a GC content of 38.9% and three plasmids (GenBank accession no. CP084922, CP084923, and CP084924). Gene function was assigned to 83.4% of the 3,930 coding DNA sequences. Functional annotation of the genome revealed that the CEP14 strain possessed all genetic elements to mediate the degradation of a range of aliphatic and aromatic compounds, including n-hexane and phenol. In addition, it harbors gene clusters involved in cytosol detoxification and oxidative stress resistance, which could play a role in the mitigation of toxic chemical intermediates that can arise during the degradation of cDCE. Gene clusters for heavy metal and antibiotic resistance were also identified in the genome of CEP14. These results suggest that CEP14 may be a versatile degrader of xenobiotic compounds and well-adapted to polluted environments, where a combination of heavy metal and organic compound pollution is often found. © 2022, The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Switzerland AG.
Klíčová slova oddělená středníkem	Whole-genome shotgun sequencing;Phenol;Oxygenase;Cometabolism;cis-1,2-dichloroethene (cDCE) biodegradation;Chlorinated ethenes (CEs);Acinetobacter pittii
Stránka www, na které se nachází výsledek	https://link-springer-com.ezproxy.vscht.cz/article/10.1007/s10482-022-01752-6
DOI výsledku	10.1007/s10482-022-01752-6
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY
ISSN	0003-6072
e-ISSN	1572-9699
Svazek periodika	115
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	8
Stát vydavatele periodika	NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku	17
Strana od-do	1041-1057
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000810824300001
EID výsledku v databázi Scopus	2-s2.0-85131810254
Způsob publikování výsledku	C - Omezený přístup (Restricted Access)
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	-

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel	Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Dodavatel	MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
Rok sběru	2023
Specifikace	RIV/60461373:22330/22:43924315!RIV23-MSM-22330___
Datum poslední aktualizace výsledku	10.05.2023
Kontrolní číslo	192444953 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno GA ČR v roce 2023	RIV/60461373:22330/22:43924315 v dodávce dat RIV23-GA0-22330___

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli

Dodáno AV ČR v roce 2023	RIV/68378050:_____/22:00559438 v dodávce dat RIV23-AV0-68378050 předkladatelem Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Dodáno GA ČR v roce 2023	RIV/46747885:24620/22:00009839 v dodávce dat RIV23-GA0-24620___ předkladatelem Technická univerzita v Liberci / Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace
Dodáno MŠMT v roce 2023	RIV/68378050:_____/22:00559438 v dodávce dat RIV23-MSM-68378050 předkladatelem Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný MŠMT v programu LM	LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022)
Projekt podporovaný MŠMT v programu LT	LTAUSA19013 - Mikrobiální kometabolismus: Propagace biodegradace polutantů (2019 - 2022)