| Identifikační kód |
RIV/60461373:22310/14:43898088 |
| Název v anglickém jazyce |
Molpher: a software framework for systematic chemical space exploration |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
I - Informatika |
| Obor |
IN - Informatika |
| Rok uplatnění |
2014 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
4 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
David Hoksza (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9268421)
Daniel Svozil (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5520991)
Milan Voršilák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3650456)
Petr Škoda (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Background: Chemical space is virtual space occupied by all chemically meaningful organic compounds. It is an important concept in contemporary chemoinformatics research, and its systematic exploration is vital to the discovery of either novel drugs or new tools for chemical biology. Results: In this paper, we describe Molpher, an open-source framework for the systematic exploration of chemical space. Through a process we term 'molecular morphing', Molpher produces a path of structurally-related compounds. This path is generated by the iterative application of so-called 'morphing operators' that represent simple structural changes, such as the addition or removal of an atom or a bond. Molpher incorporates an optimized parallel exploration algorithm, compound logging and a two-dimensional visualization of the exploration process. Its feature set can be easily extended by implementing additional morphing operators, chemical fingerprints, similarity measures and visualization methods. Mol |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
Chemical biology tools; In silico ligand design; Structure generation; Lead discovery; De-novo design; Chemical space exploration |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://www.jcheminf.com/content/6/1/7 |
| DOI výsledku |
10.1186/1758-2946-6-7 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |