Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/60077344:_____/23:00571900 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) |
| Rok uplatnění | 2023 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 54 |
| Počet domácích tvůrců | 5 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Andrea Koblížková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6024742) Jiří Macas (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5717817, orcid: 0000-0003-0829-1570, scopusid: 7003387962, researcherid: G-8618-2014) Pavel Neumann (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274031, orcid: 0000-0001-6711-6639, researcherid: H-7345-2013) Petr Novák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8813728, orcid: 0000-0002-5068-9681, researcherid: A-3059-2013) Laura Avila Robledillo (státní příslušnost: ES - Španělské království, domácí tvůrce: A, researcherid: Y-2276-2019) S.U. Andersen (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) D. Angra (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) G. Aubert (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) P. Bednář (státní příslušnost: CZ - Česká republika) E. Bornhofen (státní příslušnost: DK - Dánské království) R. Boussageon (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) P.-E. Courty (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Jana Čížková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0001-7787-1849, researcherid: F-7673-2014) Jaroslav Doležel (státní příslušnost: CZ - Česká republika, orcid: 0000-0002-6263-0492, researcherid: B-7716-2008) L. I. Fechete (státní příslušnost: DK - Dánské království) A. A. Golicz (státní příslušnost: AU - Austrálie) H. Gundlach (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) A. Hallab (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) A. Himmelbach (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) L. U. Holm (státní příslušnost: FI - Finská republika) K. Cheung (státní příslušnost: US - Spojené státy americké) E. Imbert (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) L. L. Janss (státní příslušnost: DK - Dánské království) M. Jayakodi (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) S. Kaur (státní příslušnost: IN - Indická republika) G. Keeble-Gagnère (státní příslušnost: AU - Austrálie) H. Khazaei (státní příslušnost: FI - Finská republika) L. Kobrlová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Krejčí (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Kreplak (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) M. Mascher (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) T. W. Mouritzen (státní příslušnost: DK - Dánské království) M. Nadzieja (státní příslušnost: DK - Dánské království) L. K. Nielsen (státní příslušnost: DK - Dánské království) D. O’Sullivan (státní příslušnost: IE - Irsko) J. Orabi (státní příslušnost: NO - Norské království) S. Padmarasu (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) T. Robertson-Shersby-Harvie (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) A. Schiemann (státní příslušnost: NO - Norské království) I. Schubert (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) A. H. Schulman (státní příslušnost: FI - Finská republika) P. Smýkal (státní příslušnost: CZ - Česká republika) R. J. Snowdon (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) N. Stein (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) F. L. Stoddard (státní příslušnost: FI - Finská republika) J. Stougaard (státní příslušnost: DK - Dánské království) J. Tanskanen (státní příslušnost: FI - Finská republika) N. Tayeh (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) P. Törönen (státní příslušnost: FI - Finská republika) A. M. Torres (státní příslušnost: ES - Španělské království) C. Usadel (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) A. O. Warsame (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) A. H.J. Wittenberg (státní příslušnost: NL - Nizozemsko) H. Zhang (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Increasing the proportion of locally produced plant protein in currently meat-rich diets could substantially reduce greenhouse gas emissions and loss of biodiversity1. However, plant protein production is hampered by the lack of a cool-season legume equivalent to soybean in agronomic value2. Faba bean (Vicia faba L.) has a high yield potential and is well suited for cultivation in temperate regions, but genomic resources are scarce. Here, we report a high-quality chromosome-scale assembly of the faba bean genome and show that it has expanded to a massive 13 Gb in size through an imbalance between the rates of amplification and elimination of retrotransposons and satellite repeats. Genes and recombination events are evenly dispersed across chromosomes and the gene space is remarkably compact considering the genome size, although with substantial copy number variation driven by tandem duplication. Demonstrating practical application of the genome sequence, we develop a targeted genotyping assay and use high-resolution genome-wide association analysis to dissect the genetic basis of seed size and hilum colour. The resources presented constitute a genomics-based breeding platform for faba bean, enabling breeders and geneticists to accelerate the improvement of sustainable protein production across the Mediterranean, subtropical and northern temperate agroecological zones. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | NUCLEAR-DNA CONTENT;SEQUENCE;PROGRAM |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://doi.org/10.1038/s41586-023-05791-5 |
| DOI výsledku | 10.1038/s41586-023-05791-5 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Nature |
|---|---|
| ISSN | 0028-0836 |
| e-ISSN | 1476-4687 |
| Svazek periodika | 615 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 7953 |
| Stát vydavatele periodika | DE - Spolková republika Německo |
| Počet stran výsledku | 7 |
| Strana od-do | 652-659 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000946936400008 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85149526112 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Biologické centrum AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2024 |
| Specifikace | RIV/60077344:_____/23:00571900!RIV24-MSM-60077344 |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 24.05.2024 |
| Kontrolní číslo | 192529307 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno AV ČR v roce 2024 | RIV/60077344:_____/23:00571900 v dodávce dat RIV24-AV0-60077344 |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2024 | RIV/60077344:_____/23:00571900 v dodávce dat RIV24-GA0-60077344 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2024 | RIV/61389030:_____/23:00571900 v dodávce dat RIV24-AV0-61389030 předkladatelem Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2024 | RIV/61989592:15310/23:73620978 v dodávce dat RIV24-MSM-15310___ předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
|---|