Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGenome-Wide Analysis of Repeat Diversity across the Family Musaceae (2014)výskyt výsledku

Identifikační kód	RIV/60077344:_____/14:00430448
Název v anglickém jazyce	Genome-Wide Analysis of Repeat Diversity across the Family Musaceae
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	-
Jazyk	eng - angličtina
Obor - skupina	E - Biovědy
Obor	EB - Genetika a molekulární biologie
Rok uplatnění	2014
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	6
Počet tvůrců celkem	6
Počet domácích tvůrců	4
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců	Andrea Koblížková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6024742) Jiří Macas (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5717817) Pavel Neumann (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274031) Petr Novák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8813728) Jaroslav Doležel (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Eva Hřibová (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce	Background: The banana family (Musaceae) includes genetically a diverse group of species and their diploid and polyploid hybrids that are widely cultivated in the tropics. In spite of their socio-economic importance, the knowledge of Musaceae genomes isbasically limited to draft genome assemblies of two species, Musa acuminata and M. balbisiana. Here we aimed to complement this information by analyzing repetitive genome fractions of six species selected to represent various phylogenetic groups within the family. Results: Low-pass sequencing of M. acuminata, M. ornata, M. textilis, M. beccarii, M. balbisiana, and Ensete gilletii genomes was performed using a 454/Roche platform. Sequence reads were subjected to analysis of their overall intra-and interspecific similarities and, all major repeat families were quantified using graph-based clustering.
Klíčová slova oddělená středníkem	Generation sequencing reveals; transposable elements; retrotransposons
Stránka www, na které se nachází výsledek	-
DOI výsledku	10.1371/journal.pone.0098918
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	PLoS ONE
ISSN	1932-6203
e-ISSN	-
Svazek periodika	9
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	6
Stát vydavatele periodika	US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku	12
Strana od-do
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000337738600014
EID výsledku v databázi Scopus	-
Způsob publikování výsledku	-
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	-

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Dodavatel	MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
Rok sběru	2015
Specifikace	RIV/60077344:_____/14:00430448!RIV15-MSM-60077344
Datum poslední aktualizace výsledku	12.05.2015
Kontrolní číslo	152542517

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno AV ČR v roce 2015	RIV/60077344:_____/14:00430448 v dodávce dat RIV15-AV0-60077344/01:1
Dodáno GA ČR v roce 2015	RIV/60077344:_____/14:00430448 v dodávce dat RIV15-GA0-60077344/01:1

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli

Dodáno AV ČR v roce 2015	RIV/61389030:_____/14:00430448 v dodávce dat RIV15-AV0-61389030/01:1 předkladatelem Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Dodáno GA ČR v roce 2015	RIV/61389030:_____/14:00430448 v dodávce dat RIV15-GA0-61389030/01:1 předkladatelem Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Dodáno MŠMT v roce 2015	RIV/61389030:_____/14:00430448 v dodávce dat RIV15-MSM-61389030/01:1 předkladatelem Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný MŠMT v programu LH	LH11058 - Repetitivní DNA a její význam pro strukturu a funkci rostlinného genomu (2011 - 2014)