| Identifikační kód |
RIV/60077344:_____/10:00347407 |
| Název v anglickém jazyce |
Evaluating the Effects of the Nonplanarity of Nucleic Acid Bases on NMR, IR, and Vibrational Circular Dichroism Spectra: A Density Functional Theory Computational Study |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
C - Chemie |
| Obor |
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Rok uplatnění |
2010 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
3 |
| Počet domácích tvůrců |
1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Lukáš Trantírek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3971554)
Vladimír Sychrovský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 7566794)
Zuzana Vokáčová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 5868424) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
The pyramidalizations of N9/1 glycosidic nitrogens in DNA and RNA nucleosides were found to have significant effects on the structural interpretation of the 3J(C4/2-H1) and 3J(C8/6-H1) NMR scalar couplings in purine/pyrimidine nucleosides. The calculatedstructural deforomations in nucleosides are depended on sugar-to-base orientation. The sign alternation of this correction in syn and anti nucleosides arises from the stereoinversion of the N9/1 glycosidic nitrogen occurring upon reorientation of the glycosidic torsion. Utilization of the calculated phase-shift corrections in the design of Karplus equations for the 3J couplings was suggested, and the effects on structural interpretation of the experimental couplings were evaluated. The calculated effects on IR and vibrational circular dichroism (VCD) spectra were only minor. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
3J(C8/6-H1'; 3JC4/2-H1'; VCDS |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |