Zpět na hledáníNovel high-affinity binders of human interferon gamma derived from albumin-binding domain of protein G (2012)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/44555601:13440/12:43883912 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Novel high-affinity binders of human interferon gamma derived from albumin-binding domain of protein G |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2012 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 17 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jan Malý (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2400618) Alena Semerádtová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6021875) J. N. Ahmand (státní příslušnost: CZ - Česká republika) L. Biedermanová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Černý (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Homola (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Kuchař (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Li (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Petr Malý (státní příslušnost: CZ - Česká republika) P. Mikulecký (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Radim Osička (státní příslušnost: CZ - Česká republika) H. Petroková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Polínek (státní příslušnost: CZ - Česká republika) O. Staněk (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Petr Šebo (státní příslušnost: CZ - Česká republika) H. Šípová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Vondrášek (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Recombinant ligands derived from small protein scaffolds show promise as robust research and diagnostic reagents and next generation protein therapeutics. Here, we derived high-affinity binders of human interferon gamma (hIFNgama) from the three helix bundle scaffold of the albumin-binding domain (ABD) of protein G from Streptococcus G148. Computational interaction energy mapping, solvent accessibility assessment, and in silico alanine scanning identified 11 residues from the albumin-binding surface ofABD as suitable for randomization. A corresponding combinatorial ABD scaffold library was synthesized and screened for hIFNgama binders using in vitro ribosome display selection, to yield recombinant ligands that exhibited K d values for hIFNgama from 0.2 to 10 nM. Molecular modeling, computational docking onto hIFNgama, and in vitro competition for hIFNgama binding revealed that four of the best ABD-derived ligands shared a common binding surface on hIFNgama, which differed from the sit |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Ribosome display; Recombinant ligand; Protein scaffold; Computational design; Combinatorial library |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/prot.23234/pdf |
| DOI výsledku | https://doi.org/10.1002/prot.23234 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Proteins-structure function and bioinformatics |
|---|---|
| ISSN | 0887-3585 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 80 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 3 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 16 |
| Strana od-do | 774-789 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000300053500026 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Ústí nad Labem / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR ) |
| Rok sběru | 2013 |
| Specifikace | RIV/44555601:13440/12:43883912!RIV13-AV0-13440___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 17.05.2013 |
| Kontrolní číslo | 43658527 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2013 | RIV/86652036:_____/12:00385253 v dodávce dat RIV13-AV0-86652036/01:1 předkladatelem Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno AV ČR v roce 2013 | RIV/61388971:_____/12:00385253 v dodávce dat RIV13-AV0-61388971/03:2 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno AV ČR v roce 2013 | RIV/67985882:_____/12:00385253 v dodávce dat RIV13-AV0-67985882/01:1 předkladatelem Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | RIV/86652036:_____/12:00385253 v dodávce dat RIV13-GA0-86652036/01:1 předkladatelem Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný AV ČR v programu KA | KAN200520702 - Nanoimunosenzory pro detekci cytokinů (2007 - 2011) |
|---|