Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/21:00124277 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | LYmphoid NeXt-Generation Sequencing (LYNX) Panel A Comprehensive Capture-Based Sequencing Tool for the Analysis of Prognostic and Predictive Markers in Lymphoid Malignancies |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 30109 - Pathology |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 15 |
| Počet domácích tvůrců | 14 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Michael Doubek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1248790, orcid: 0000-0002-1269-6282) Jakub Hynšt (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2086619, orcid: 0000-0002-0079-845X) Andrea Janíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7801386, orcid: 0000-0002-2647-7769) Jana Kotašková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5802245, orcid: 0000-0003-1672-7346) Andrea Marečková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6705057, orcid: 0000-0001-9096-9680) Veronika Navrkalová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5626129, orcid: 0000-0003-3020-1578, researcherid: E-1331-2012) Karol Pál (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5773857) Anna Panovská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8953147, orcid: 0000-0003-4955-3039) Šárka Pavlová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5327903, orcid: 0000-0003-1528-9743, researcherid: D-2139-2011) Karla Plevová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3655083, orcid: 0000-0002-6148-8877, scopusid: 36145332700, researcherid: E-1088-2012) Šárka Pospíšilová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1957864, orcid: 0000-0001-7136-2680) Tomáš Reigl (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4550229) Kamila Stránská (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1523501) Zuzana Vrzalová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1070320, orcid: 0000-0002-1282-6956) Hana Jelínková (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | B-cell neoplasms represent a clinically heterogeneous group of hematologic malignancies with considerably diverse genomic architecture recently endorsed by next-generation sequencing (NGS) studies. Because multiple genetic defects have a potential or confirmed clinical impact, a tendency toward more comprehensive testing of diagnostic, prognostic, and predictive markers is desired. This study introduces the design, validation, and implementation of an integrative, custom-designed, capture-based NGS panel titled LYmphoid NeXt-generation sequencing (LYNX) for the analysis of standard and novel molecular markers in the most common lymphoid neoplasms (chronic lymphocytic leukemia, acute lymphoblastic leukemia, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and mantle cell lymphoma). A single LYNX test provides the following: i) accurate detection of mutations in all coding exons and splice sites of 70 lymphoma-related genes with a sensitivity of 5% variant allele frequency, ii) reliable identification of large genome-wide (>6 Mb) and recurrent chromosomal aber-rations (>300 kb) in at least 20% of the clonal cell fraction, iii) the assessment of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements, and iv) lymphoma-specific translocation detection. Dedicated bioinformatic pipelines were designed to detect all markers mentioned above. The LYNX panel repre-sents a comprehensive, up-to-date tool suitable for routine testing of lymphoid neoplasms with research and clinical applicability. It allows a wide adoption of capture-based targeted NGS in clinical practice and personalized management of patients with lymphoproliferative diseases. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | LYNX;Lymphoid Malignancies;Prognostic and Predictive Markers |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1525157821001343?via%3Dihub |
| DOI výsledku | 10.1016/j.jmoldx.2021.05.007 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | The journal of molecular diagnostics. |
|---|---|
| ISSN | 1525-1578 |
| e-ISSN | 1943-7811 |
| Svazek periodika | 23 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 8 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 16 |
| Strana od-do | 959-974 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000678377900007 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85110298539 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/21:00124277!RIV22-MSM-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 27.05.2022 |
| Kontrolní číslo | 192409879 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno GA ČR v roce 2022 | RIV/65269705:_____/21:00074448 v dodávce dat RIV22-GA0-65269705 předkladatelem Fakultní nemocnice Brno |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/65269705:_____/21:00074448 v dodávce dat RIV22-MSM-65269705 předkladatelem Fakultní nemocnice Brno |
| Dodáno MZ v roce 2022 | RIV/65269705:_____/21:00074448 v dodávce dat RIV22-MZ0-65269705 předkladatelem Fakultní nemocnice Brno |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015091 - Národní centrum lékařské genomiky (2016 - 2017) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018140 - e-Infrastruktura CZ (2020 - 2022) |