Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/21:00122430 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10608 - Biochemistry and molecular biology |
| Rok uplatnění | 2021 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Počet tvůrců celkem | 10 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jaroslav Koča (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4347374, orcid: 0000-0002-2780-4901, researcherid: E-4460-2012) David Sehnal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274740, orcid: 0000-0002-0682-3089) Radka Svobodová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3876500, orcid: 0000-0002-3840-8760, scopusid: 16235290700, researcherid: E-2867-2012) V. Bazgier (státní příslušnost: CZ - Česká republika) K. Berka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) S. Bittrich (státní příslušnost: CZ - Česká republika) S.K. Burley (státní příslušnost: CZ - Česká republika) M. Deshpande (státní příslušnost: CZ - Česká republika) A.S. Rose (státní příslušnost: CZ - Česká republika) S. Velankar (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Large biomolecular structures are being determined experimentally on a daily basis using established techniques such as crystallography and electron microscopy. In addition, emerging integrative or hybrid methods (I/HM) are producing structural models of huge macromolecular machines and assemblies, sometimes containing 100s of millions of non-hydrogen atoms. The performance requirements for visualization and analysis tools delivering these data are increasing rapidly. Significant progress in developing online, web-native three-dimensional (3D) visualization tools was previously accomplished with the introduction of the LiteMol suite and NGL Viewers. Thereafter, Mol* development was jointly initiated by PDBe and RCSB PDB to combine and build on the strengths of LiteMol (developed by PDBe) and NGL (developed by RCSB PDB). The web-native Mol* Viewer enables 3D visualization and streaming of macromolecular coordinate and experimental data, together with capabilities for displaying structure quality, functional, or biological context annotations. High-performance graphics and data management allows users to simultaneously visualise up to hundreds of (superimposed) protein structures, stream molecular dynamics simulation trajectories, render cell-level models, or display huge I/HM structures. It is the primary 3D structure viewer used by PDBe and RCSB PDB. It can be easily integrated into third-party services. Mol* Viewer is open source and freely available at https://molstar.org/. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | MOLECULAR-DYNAMICSDATABASE |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://academic.oup.com/nar/article/49/W1/W431/6270780#267023333 |
| DOI výsledku | 10.1093/nar/gkab314 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Nucleic acids research |
|---|---|
| ISSN | 0305-1048 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 49 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | W1 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 7 |
| Strana od-do | „W431“-„W437“ |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000672775800055 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85108991908 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2022 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/21:00122430!RIV22-MSM-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 27.05.2022 |
| Kontrolní číslo | 192409810 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2022 | RIV/61989592:15310/21:73609389 v dodávce dat RIV22-MSM-15310___ předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EF | EF16_013/0001777 - ELIXIR-CZ: Budování kapacit (2017 - 2021) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |