Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/20:00117897 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | PDBe: improved findability of macromolecular structure data in the PDB |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10608 - Biochemistry and molecular biology |
| Rok uplatnění | 2020 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 31 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Romana Gáborová (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7322949) Jaroslav Koča (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4347374, orcid: 0000-0002-2780-4901, researcherid: E-4460-2012) David Sehnal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274740, orcid: 0000-0002-0682-3089) Radka Svobodová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3876500, orcid: 0000-0002-3840-8760) Stephen Anyango (státní příslušnost: CZ - Česká republika) David R. Armstrong (státní příslušnost: CZ - Česká republika) John M. Berrisford (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Alice R. Clark (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Matthew J. Conroy (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Jose M. Dana (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Mandar Deshpande (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Roisin Dunlop (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Paul Gane (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Deepti Gupta (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Aleksandras Gutmanas (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Pauline Haslam (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Preeti Choudhary (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Gerard J. Kleywegt (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Lora Mak (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Saqib Mir (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Abhik Mukhopadhyay (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Nurul Nadzirin (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Sreenath Nair (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Typhaine Paysan-Lafosse (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Lukas Pravda (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Osman Salih (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Oliver Smart (státní příslušnost: CZ - Česká republika) James Tolchard (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Mihaly Varadi (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Sameer Velankar (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Hossam Zaki (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The Protein Data Bank in Europe (PDBe), a founding member of the Worldwide Protein Data Bank (wwPDB), actively participates in the deposition, curation, validation, archiving and dissemination of macromolecular structure data. PDBe supports diverse research communities in their use of macromolecular structures by enriching the PDB data and by providing advanced tools and services for effective data access, visualization and analysis. This paper details the enrichment of data at PDBe, including mapping of RNA structures to Rfam, and identification of molecules that act as cofactors. PDBe has developed an advanced search facility with similar to 100 data categories and sequence searches. New features have been included in the LiteMol viewer at PDBe, with updated visualization of carbohydrates and nucleic acids. Small molecules are now mapped more extensively to external databases and their visual representation has been enhanced. These advances help users to more easily find and interpret macromolecular structure data in order to solve scientific problems. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | PDBe;Structural Biology;Molecular Graphics;Data Curation |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://doi.org/10.1093/nar/gkz990 |
| DOI výsledku | 10.1093/nar/gkz990 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Nucleic acids research |
|---|---|
| ISSN | 0305-1048 |
| e-ISSN | 1362-4962 |
| Svazek periodika | 48 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | D1 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 9 |
| Strana od-do | „D335“-„D343“ |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000525956700047 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85077669911 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2021 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/20:00117897!RIV21-MSM-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 19.05.2021 |
| Kontrolní číslo | 192310774 ( v1.0 ) |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EF | EF16_013/0001777 - ELIXIR-CZ: Budování kapacit (2017 - 2021) |
|---|---|
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |