| Identifikační kód |
RIV/00216224:14740/19:00113368 |
| Název v anglickém jazyce |
Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10608 - Biochemistry and molecular biology |
| Rok uplatnění |
2019 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
1 |
| Počet tvůrců celkem |
2 |
| Počet domácích tvůrců |
1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
David Sehnal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274740)
O.C. Grant (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
The representation of carbohydrates in 3D space using symbols is a powerful visualization method, but such representations are lacking in currently available visualization software. The work presented here allows researchers to display carbohydrate 3D structures as 3D-SNFG symbols using LiteMol from a web browser (e.g., v.litemol.org/?loadFromCS=5T3X). Any PDB ID can be substituted at the end of the URL. Alternatively, the user may enter a PDB ID or upload a structure. LiteMol is available at https://v.litemol.org and automatically depicts any carbohydrate residues as 3D-SNFG symbols. To embed LiteMol in a webpage, visit https://github.com/dsehnal/LiteMol. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
oligosaccharide;glycan;carbohydrate;glycoprotein;SNFG;3D-SNFG;visualization;LiteMol;structure;symbol nomenclature for glycans |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00473 |
| DOI výsledku |
10.1021/acs.jproteome.8b00473 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |