Zpět na hledáníLimitations of routine MALDI-TOF mass spectrometric identification of Acinetobacter species and remedial actions (2018)detail výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/18:00101425 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Limitations of routine MALDI-TOF mass spectrometric identification of Acinetobacter species and remedial actions |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10606 - Microbiology |
| Rok uplatnění | 2018 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | A set of 204 taxonomically well-defined strains belonging to 17 Acinetobacter spp., including 11 recently described species (A. albensis, A. bohemicus, A. colistiniresistens, A. courvalinii, A. dispersus, A. gandensis, A. modestus, A. proteolyticus, A. seifertii, A. variabilis, and A. vivianii) and six species of the so-called haemolytic Glade (A. beijerinckii, A. gyllenbergii, A. haemolyticus, A. junii, A. parvus, and A. venetianus), were subjected to MALDI-TOF mass spectrometric profiling. The identification outputs were evaluated using the current version (8.0.0.0) of the commercially available Bruker Daltonics, Biotyper database, which does not contain reference entries for six of the species tested. Up to 29% of the strains were falsely identified as different Acinetobacter spp. present in the Biotyper database, resulting mostly from the close phylogenetic relationship of species of the haemolytic Glade. To obtain more reliable identification, extending the commercial database showed only partial improvement, while the use of an alternative MALDI matrix solution (strongly acidified ferulic acid) allowed correct identification of nearly all problematic strains. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Acinetobacter spp.;Bacteria profiling;BioTyper;MALDI-TOF MS |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1016/j.mimet.2018.10.009 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Microbiological Methods |
|---|---|
| ISSN | 0167-7012 |
| e-ISSN | 1872-8359 |
| Svazek periodika | 154 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | NOV 2018 |
| Stát vydavatele periodika | NL - Nizozemsko |
| Počet stran výsledku | 7 |
| Strana od-do | 79-85 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000451490900013 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85055331602 |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Informace o všech výskytech výsledku v rámci detailu výsledku
| Dodáno GA ČR v roce 2019 | RIV/00216224:14740/18:00101425 v dodávce dat RIV19-GA0-14740___/01:1 předkladatelem Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2019 | RIV/00216224:14740/18:00101425 v dodávce dat RIV19-MSM-14740___/01:1 předkladatelem Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
| Dodáno MŠMT v roce 2019 | RIV/00216208:11120/18:43917216 v dodávce dat RIV19-MSM-11120___/01:1 předkladatelem Univerzita Karlova / 3. lékařská fakulta |
| Dodáno MZ v roce 2019 | RIV/75010330:_____/18:00012469 v dodávce dat RIV19-MZ0-75010330/03:1 předkladatelem Státní zdravotní ústav, Praha |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EF | EF16_013/0001776 - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii pro lidské zdraví (2017 - 2021) |
|---|---|
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GB | GBP206/12/G151 - Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice (2012 - 2018) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015043 - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (2016 - 2017) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LQ | LQ1601 - CEITEC 2020 (2016 - 2020) |