| Identifikační kód |
RIV/00216224:14740/18:00101425 |
| Název v anglickém jazyce |
Limitations of routine MALDI-TOF mass spectrometric identification of Acinetobacter species and remedial actions |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Vědní obor |
10606 - Microbiology |
| Rok uplatnění |
2018 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
4 |
| Počet domácích tvůrců |
2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Ondrej Šedo (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9410139, researcherid: D-9868-2012)
Zbyněk Zdráhal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4568567, researcherid: D-9491-2012)
Alexandr Nemec (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Lenka Radolfová-Křížová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
A set of 204 taxonomically well-defined strains belonging to 17 Acinetobacter spp., including 11 recently described species (A. albensis, A. bohemicus, A. colistiniresistens, A. courvalinii, A. dispersus, A. gandensis, A. modestus, A. proteolyticus, A. seifertii, A. variabilis, and A. vivianii) and six species of the so-called haemolytic Glade (A. beijerinckii, A. gyllenbergii, A. haemolyticus, A. junii, A. parvus, and A. venetianus), were subjected to MALDI-TOF mass spectrometric profiling. The identification outputs were evaluated using the current version (8.0.0.0) of the commercially available Bruker Daltonics, Biotyper database, which does not contain reference entries for six of the species tested. Up to 29% of the strains were falsely identified as different Acinetobacter spp. present in the Biotyper database, resulting mostly from the close phylogenetic relationship of species of the haemolytic Glade. To obtain more reliable identification, extending the commercial database showed only partial improvement, while the use of an alternative MALDI matrix solution (strongly acidified ferulic acid) allowed correct identification of nearly all problematic strains. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
Acinetobacter spp.;Bacteria profiling;BioTyper;MALDI-TOF MS |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| DOI výsledku |
10.1016/j.mimet.2018.10.009 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |