Zpět na hledáníFilter-Aided Sample Preparation Procedure for Mass Spectrometric Analysis of Plant Histones (2018)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/18:00101214 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Filter-Aided Sample Preparation Procedure for Mass Spectrometric Analysis of Plant Histones |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10406 - Analytical chemistry |
| Rok uplatnění | 2018 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 7 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Sylva Brabencová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4927224) Miloslava Fojtová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3129888) Hana Kuchaříková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3713112) Dominika Ledvinová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4746648) Gabriela Lochmanová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6323685, researcherid: D-9876-2012) Kamil Mikulášek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8386366) Zbyněk Zdráhal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4568567, researcherid: D-9491-2012) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Characterization of histone post-translational modifications (PTMs) is still challenging, and robust histone sample preparation is essential for convincing evaluation of PTMs by mass spectrometry. An effective protocol for extracting plant histone proteins must also avoid excessive co-extraction of the numerous potential interfering compounds, including those related to secondary metabolism. Currently, the co-existence of histone marks is addressed mostly by shotgun proteomic analysis following chemical derivatization of histone lysine residues. Here, we report a straightforward approach for plant histone sample preparation for mass spectrometry, based on filter-aided sample preparation coupled with histone propionylation. The approach offers savings in sample handling and preparation time, enables removal of interfering compounds from the sample, and does not require either precipitation or dialysis of histone extract. We show the comparison of two protocol variants for derivatization of histone proteins, in-solution propionylation in the vial and propionylation on the filter unit. For both protocols, we obtained identical abundances of post-translationally modified histone peptides. Although shorter time is required for histone protein labeling on the filter unit, in-solution derivatization slightly outweighed filter-based variant by lower data variability. Nevertheless, both protocol variants appear to be efficient and convenient approach for preparation of plant histones for mass spectrometric analysis. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | histone derivatization;filter-aided sample preparation;post-translational modifications;epigenetics;mass spectrometry;Arabidopsis thaliana |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.3389/fpls.2018.01373 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Frontiers in Plant Science |
|---|---|
| ISSN | 1664-462X |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 9 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | SEP |
| Stát vydavatele periodika | CH - Švýcarská konfederace |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 1373 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000444989900002 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85054507747 |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2019 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/18:00101214!RIV19-MSM-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 16.05.2019 |
| Kontrolní číslo | 192115683 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2019 | RIV/00216224:14740/18:00101214 v dodávce dat RIV19-GA0-14740___/01:1 |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GA16-04653S - Epigenetické mechanismy určující stabilitu rostlinných telomer (2016 - 2018) |
|---|---|
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GB | GBP206/12/G151 - Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice (2012 - 2018) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015043 - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (2016 - 2017) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015085 - CERIT Scientific Cloud (2016 - 2017) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LQ | LQ1601 - CEITEC 2020 (2016 - 2020) |