| Identifikační kód |
RIV/00216224:14740/16:00087797 |
| Název v anglickém jazyce |
chromDraw: an R package for visualization of linear and circular karyotypes |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
C - Chemie |
| Obor |
CE - Biochemie |
| Rok uplatnění |
2016 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
2 |
| Počet domácích tvůrců |
2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Jan Janečka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9796640)
Martin Lysák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3881741) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Species-specific sets of chromosomes-karyotypes-are traditionally depicted as linear ideograms with individual chromosomes represented by vertical bars. However, linear visualization has its limitations when the shared collinearity and/or chromosomal rearrangements differentiating two or more karyotypes need to be demonstrated. In these instances, circular visualization might provide easier comprehension and interpretation of inter-species chromosomal collinearity. The chromDraw graphical tool was developed as a user-friendly graphical tool for visualizing both linear and circular karyotypes based on the same input data matrix. The output graphics, saved in two different formats (EPS and SVG), can be easily imported to and modified in presentation and image-editing computer programs. The tool is freely distributed under GNU General Public License (GPL) and can be installed from Bioconductor or from the chromDraw home page. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
Visualization;Chromosome;Karyotype;R |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
http://link.springer.com/article/10.1007/s10577-015-9513-5 |
| DOI výsledku |
10.1007/s10577-015-9513-5 |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |