Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Rejstřík informací o výsledcích

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníGenome expansion of Arabis alpina linked with retrotransposition and reduced symmetric DNA methylation (2015)výskyt výsledku

Identifikační kód RIV/00216224:14740/15:00081444
Název v anglickém jazyce Genome expansion of Arabis alpina linked with retrotransposition and reduced symmetric DNA methylation
Druh J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh -
Jazyk eng - angličtina
Obor - skupina E - Biovědy
Obor EF - Botanika
Rok uplatnění 2015
Kód důvěrnosti údajů S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku 2
Počet tvůrců celkem 39
Počet domácích tvůrců 2
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců Martin Lysák (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3881741)
Terezie Mandáková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1629239)
Maria C. Albani (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Carlos Alonso-Blanco (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Cristina Barrero-Sicilia (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Claude Becker (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Sara Bergonzi (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Markus C. Berns (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Nora Bujdoso (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Pilar Carbonero (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Loren Castaings (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Vincent Colot (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
George Coupland (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Seth J. Davis (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Laura de Lorenzo (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Joerg Hagmann (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Romy Chen-Min-Tao (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Claudia Chica (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Raquel Iglesias-Fernandez (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Geo Velikkakam James (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Christiane Kiefer (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Isabel Mateos (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Julieta L. Mateos (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Florian Maumus (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Karl J. V. Nordstrom (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Javier Paz-Ares (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Aleš Pečinka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 2928159)
Mathieu Piednoel (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Thomas Piofczyk (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Hadi Quesneville (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Vimal Rawat (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Francois Roudier (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Korbinian Schneeberger (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Stephan C. Schuster (státní příslušnost: US - Spojené státy americké)
Bogna Szarzynska (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Norman Warthmann (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Detlef Weigel (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Eva-Maria Willing (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Matthias Zytnicki (státní příslušnost: FR - Francouzská republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce Despite evolutionary conserved mechanisms to silence transposable element activity, there are drastic differences in the abundance of transposable elements even among closely related plant species. We conducted a de novo assembly for the 375 Mb genome ofthe perennial model plant, Arabis alpina. Analysing this genome revealed long-lasting and recent transposable element activity predominately driven by Gypsy long terminal repeat retrotransposons, which extended the low-recombining pericentromeres and transformed large formerly euchromatic regions into repeat-rich pericentromeric regions. This reduced capacity for long terminal repeat retrotransposon silencing and removal in A. alpina co-occurs with unexpectedly low levels of DNA methylation. Most remarkably, the striking reduction of symmetrical CG and CHG methylation suggests weakened DNA methylation maintenance in A. alpina compared with Arabidopsis thaliana.
Klíčová slova oddělená středníkem ARABIDOPSIS-THALIANA; PROVIDES INSIGHT; EVOLUTION; LYRATA; DIVERGENCE; SEQUENCE; REVEALS; SIZE
Stránka www, na které se nachází výsledek http://www.nature.com/articles/nplants201423
DOI výsledku 10.1038/NPLANTS.2014.23
Odkaz na údaje z výzkumu -

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika NATURE PLANTS
ISSN 2055-026X
e-ISSN -
Svazek periodika 1
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku 2
Stát vydavatele periodika GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku 7
Strana od-do 1-7
Kód UT WoS článku podle Web of Science 000364389500001
EID výsledku v databázi Scopus -
Způsob publikování výsledku -
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku -

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Dodavatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru 2016
Specifikace RIV/00216224:14740/15:00081444!RIV16-GA0-14740___
Datum poslední aktualizace výsledku 17.05.0016
Kontrolní číslo 191706951 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno MŠMT v roce 2016 RIV/00216224:14740/15:00081444 v dodávce dat RIV16-MSM-14740___/01:1

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný MŠMT v programu EE EE2.3.20.0189 - Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace (2012 - 2015)
Projekt podporovaný MŠMT v programu EE EE2.3.30.0037 - Zaměstnáním nejlepších mladých vědců k rozvoji mezinárodní spolupráce (2013 - 2015)
Projekt podporovaný GA ČR v programu GB GBP501/12/G090 - Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin (2012 - 2018)
Vyhledávání ...