Zpět na hledáníMOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels (2012)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/12:00057571 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Rok uplatnění | 2012 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 10 |
| Počet domácích tvůrců | 5 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Crina-Maria Ionescu (státní příslušnost: RO - Rumunsko, domácí tvůrce: A) Deepti Jaiswal (státní příslušnost: IN - Indická republika, domácí tvůrce: A) Jaroslav Koča (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4347374) David Sehnal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1274740) Radka Svobodová Vařeková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3876500) Pavel Banáš (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 1878220) Karel Berka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Ondřej Hanák (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Veronika Navrátilová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Michal Otyepka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 3151948) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Biomolecular channels play important roles in many biological systems, e.g. enzymes, ribosomes and ion channels. This article introduces a web-based interactive MOLEonline 2.0 application for the analysis of access/egress paths to interior molecular voids. MOLEonline 2.0 enables platform-independent, easy-to-use and interactive analyses of (bio)macromolecular channels, tunnels and pores. Results are presented in a clear manner, making their interpretation easy. For each channel, MOLEonline displays a 3Dgraphical representation of the channel, its profile accompanied by a list of lining residues and also its basic physicochemical properties. The users can tune advanced parameters when performing a channel search to direct the search according to theirneeds. The MOLEonline 2.0 application is freely available via the Internet at http://ncbr.muni.cz/mole or http://mole.upol.cz. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | CYTOCHROMES P450; PROTEIN STRUCTURES; NUCLEIC-ACIDS; SUBSTRATE PREFERENCES; POTASSIUM CHANNEL; PHOTOSYSTEM-II; ACTIVE-SITES; IDENTIFICATION; TUNNELS; MACROMOLECULES |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | http://nar.oxfordjournals.org/content/40/W1/W222.full |
| DOI výsledku | 10.1093/nar/gks363 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Nucleic Acids Research |
|---|---|
| ISSN | 0305-1048 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 40 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | W1 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 6 |
| Strana od-do | "W222"-"W227" |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000306670900036 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2013 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/12:00057571!RIV13-GA0-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 04.09.2013 |
| Kontrolní číslo | 43549624 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2013 | RIV/00216224:14740/12:00057571 v dodávce dat RIV13-MSM-14740___/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | RIV/61989592:15310/12:33142298 v dodávce dat RIV13-GA0-15310___/02:3 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2013 | RIV/61989592:15310/12:33142298 v dodávce dat RIV13-MSM-15310___/02:2 předkladatelem Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ED | ED1.1.00/02.0068 - CEITEC - central european institute of technology (2011 - 2015) |
|---|---|
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GD | GD301/09/H004 - Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny (2009 - 2012) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ME | ME08008 - Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik (2008 - 2012) |