| Identifikační kód |
RIV/00216224:14740/11:00049969 |
| Název v anglickém jazyce |
Carbohydrate CH/pi interactions ? Theoretical investigation of the favourable regions in the carbohydrate surroundings |
| Druh |
O - Ostatní výsledky, které nelze zařadit do žádného z definovaných druhů výsledků |
| Jazyk |
eng - angličtina |
| Obor - skupina |
C - Chemie |
| Obor |
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Rok uplatnění |
2011 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
2 |
| Počet tvůrců celkem |
4 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Jaroslav Koča (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4347374)
Stanislav Kozmon (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8988250)
Radek Matuška (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8499896)
Vojtěch Spiwok (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Molecular recognition of carbohydrates by proteins plays a key role in many biological processes including immune response, pathogen entry into a cell, cell-cell adhesion and so forth. The list of proteins that recognise carbohydrates via aromatic residues include lectins, carbohydrate-binding modules, glycosidases, glycosyl transferases, ?greasy slides? of carbohydrate transporters and complimentary sugar-binding sites (?sugar tongs?). Carbohydrates typically interact with aromatic systems in a parallel orientation. In this study we present the first systematic computational three-dimensional scan of carbohydrate hydrophobic patches for the ability to interact via CH/pi dispersion interactions. The carbohydrates b-D-glucopyranose, b-D-mannopyranose and a-L-fucopyranose were studied in a complex with a benzene molecule, which served as a model of the CH/pi interaction in carbohydrate/protein complexes. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
Carbohydrate; CH/pi interactions; DFT-D |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |