Zpět na hledání5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion (2011)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14740/11:00049942 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
| Obor | BO - Biofyzika |
| Rok uplatnění | 2011 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jiří Nováček (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4727126) Veronika Papoušková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7064322) Vladimír Sklenář (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3906884) Lukáš Žídek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4257707) Wiktor Kozminski (státní příslušnost: PL - Polská republika) Libor Krásný (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Hana Šanderová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Anna Zawadzka-Kazimierczuk (státní příslušnost: PL - Polská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Two novel 5D NMR experiments (CACONCACO, NCOCANCO) for backbone assignment of disordered proteins are presented. The pulse sequences exploit relaxation properties of the unstructured proteins and combine the advantages of 13C-direct detection, non-uniform sampling, and longitudinal relaxation optimization to maximize the achievable resolution and minimize the experimental time. The pulse sequences were successfully tested on the sample of partially disordered delta subunit from RNA polymerase from Bacillus subtilis. The unstructured part of this 20 kDa protein consists of 81 amino acids with frequent sequential repeats. A collection of 0.0003% of the data needed for a conventional experiment with linear sampling was sufficient to perform an unambiguousassignment of the disordered part of the protein from a single 5D spectrum. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Intrinsically disordered proteins; Non-uniform sampling; 13C detection; Longitudinal relaxation optimization; Backbone assignment |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1007/s10858-011-9496-2 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Journal of Biomolecular NMR |
|---|---|
| ISSN | 0925-2738 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 50 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 1 |
| Stát vydavatele periodika | NL - Nizozemsko |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Strana od-do | 1-11 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000290044400001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2012 |
| Specifikace | RIV/00216224:14740/11:00049942!RIV12-MSM-14740___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 07.05.2012 |
| Kontrolní číslo | 13275341 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2012 | RIV/00216224:14740/11:00049942 v dodávce dat RIV12-GA0-14740___/02:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2012 | RIV/61388971:_____/11:00367828 v dodávce dat RIV12-AV0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2012 | RIV/61388971:_____/11:00367828 v dodávce dat RIV12-GA0-61388971/01:1 předkladatelem Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GA204/09/0583 - Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií (2009 - 2012) |
|---|---|
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GAP206/11/0758 - Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi (2011 - 2013) |
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GD | GD301/09/H004 - Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny (2009 - 2012) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LC | LC06030 - Biomolekulární centrum (2006 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |