Zpět na hledáníRecognition of non-canonical DNA structures in genomic DNA sequences by p53 proteins (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/09:00048866 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Recognition of non-canonical DNA structures in genomic DNA sequences by p53 proteins |
| Druh | O - Ostatní výsledky, které nelze zařadit do žádného z definovaných druhů výsledků |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | E - Biovědy |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Miroslav Fojta (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4171373) Matej Lexa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6759890) Marie Brazdova (státní příslušnost: CZ - Česká republika) W. Deppert (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) I. Kyjovsky (státní příslušnost: CZ - Česká republika) L. Navrátilová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) E. Paleček (státní příslušnost: CZ - Česká republika) V. Tichy (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | In our analyses we combined molecular and computational approaches to understand the mutant p53 function in specific gene regulation via binding to non-canonical DNA structures in chromatin DNA. We used two glioblastoma cell lines U251 (R273H) and Onda11(R273C) expressing endogenous mutp53 proteins to isolate natural mutant p53 binding sites (mutp53BS) by genome- wide ChIP-cloning. In our computational work, we developed tools for rapid identification of DNA sequences (among the isolated mutp53BS) tending to form non-B structures (hairpins and triplex DNA) as well as for mapping their genomic locations. These sites are frequently localized in the regulatory first introns of genes and are enriched in repetitive elements. Potential to form triplex and cruciform structures was predicted by developed computational tools and detected by enzymatic and chemical probing. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | p53; triplex DNA; DNA-binding; gene regulation |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2011 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/09:00048866!RIV11-GA0-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 30.05.2011 |
| Kontrolní číslo | 12798748 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GA204/08/1560 - Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA (2008 - 2010) |
|---|