Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníEvolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal (2023)výskyt výsledku

Identifikační kód	RIV/00216224:14310/23:00130776
Název v anglickém jazyce	Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal
Druh	J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh	J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk	eng - angličtina
Vědní obor	10611 - Plant sciences, botany
Rok uplatnění	2023
Kód důvěrnosti údajů	S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku	2
Počet tvůrců celkem	13
Počet domácích tvůrců	9
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců	Petr Bureš (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4541057, orcid: 0000-0002-0146-956X, scopusid: 57195723293) Tammy L Elliott (státní příslušnost: CA - Kanada, domácí tvůrce: A) Lucie Horová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1079883) Ester Michálková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2476849) Klára Plačková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5672245) Petr Šmarda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1528572) Jakub Šmerda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7248172) Pavel Veselý (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1282344, researcherid: A-8870-2013) František Zedek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6612229) Sebastian Ćato (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Maryam Norouzi (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Melahat Ozcan (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Masoud Sheidai (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce	Genome size and GC content are basic species-specific attributes often delimiting genera or higher taxa, which enable the identification of polyploidy, hybridization and other modes of genome or karyotype evolution. The evolution of these genomic traits can often occur as a result of the selective pressure of the environment. Here, we reconstruct the evolution of these genomic traits in subtribe Carduinae (Asteraceae) in the context of changes in chromosome numbers. Using flow cytometry, genome size and GC content were estimated for 119 taxa and mapped onto a phylogenetic tree constructed using sequences from seven genetic markers. In addition, the genomic data were compared with the length of stomatal guard cells and achene size (length, weight) to evaluate the extent to which genomic characters could evolve adaptively in this subtribe. We found strong phylogenetic signals for the analysed genomic and phenotypic traits, which delimited most Carduinae genera or clades in agreement with the reconstructed phylogeny. Monoploid genome size was positively correlated with genomic GC content and stomatal guard cell length. In Cirsium, whose species were the focus of the majority of the analyses, the large-genomed subgen. Lophiolepis had smaller guard cells, which might be related to it occurring in more xeric habitats compared to subgen. Cirsium. In contrast, the achenes of the large-genomed subgen. Lophiolepis were larger, possibly in response to the summer drought, whereas achene weight and length were independent of genome size across the subtribe. Thus, genome size in the subtribe Carduinae might evolve under weak environmental control, at least under that mediated by the size of guard cells or achenes. Achene size was related positively to GC content, which could have evolved adaptively in response to summer drought. In Carduus and the North American Cirsium taxa, there is an increase in average chromosome size with reduction in monoploid chromosome number, suggesting descending dysploidy associated with chromosomal fusion. Polyploidy is relatively rare in this subtribe and was confirmed only in five of the species studied, including Cirsium vulgare, an invasive species that likely originated via distant (intersubgeneric) hybridization, as suggested by its intermediate genomic and achene features combined with the conflict between its morphology and phylogenetic position. Phylogenetic reconstruction, differences in genomic parameters, as well as stomatal guard cell and achene sizes support the separation of a monophyletic Lophiolepis from the remainder of Cirsium. Genome and achene size results also indicate that the early diverging Cirsium italicum can be separated from the rest of the monophyletic Lophiolepis+Picnomon+Notobasis clade.
Klíčová slova oddělená středníkem	achene size;flow cytometry;genomic DNA base composition;guard cell length;nuclear DNA content;phylogeny
Stránka www, na které se nachází výsledek	https://doi.org/10.23855/preslia.2023.185
DOI výsledku	10.23855/PRESLIA.2023.185
Odkaz na údaje z výzkumu	-

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika	Preslia
ISSN	0032-7786
e-ISSN	2570-950X
Svazek periodika	95
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku	1
Stát vydavatele periodika	CZ - Česká republika
Počet stran výsledku	29
Strana od-do	185-213
Kód UT WoS článku podle Web of Science	000976524400004
EID výsledku v databázi Scopus	2-s2.0-85154044785
Způsob publikování výsledku	A - Open Access
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku	-

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel	Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Dodavatel	MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
Rok sběru	2024
Specifikace	RIV/00216224:14310/23:00130776!RIV24-MSM-14310___
Datum poslední aktualizace výsledku	30.05.2024
Kontrolní číslo	192571315 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno GA ČR v roce 2024	RIV/00216224:14310/23:00130776 v dodávce dat RIV24-GA0-14310___

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný GA ČR v programu GA	GA20-15989S - Evoluce velikosti genomu - centromerický drajv v nové roli (2020 - 2022)
Projekt podporovaný MŠMT v programu LM	LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022)
Projekt podporovaný MŠMT v programu LM	LM2018140 - e-Infrastruktura CZ (2020 - 2022)