Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/22:00126021 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology |
| Rok uplatnění | 2022 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 5 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | David Bednář (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2652773) Miloš Musil (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9197703, orcid: 0000-0001-9373-7930, scopusid: 57189901014) Peter Baráth (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Maksym Danchenko (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Peter Ferianc (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Katarína Chovanová (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Andrej Poljovka (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Marcel Zámocký (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Simple Summary Fungi are well equipped to cope with oxidative stress and the reactive oxygen species that are, in the case of phytopathogens, produced mainly by the plant host for defence purposes. Peroxidases represent the major line of evolution for rapid decomposition of harmful peroxides in all aerobically metabolising organisms. In all the sequenced fungal genomes, many divergent genes coding for various peroxidases have been discovered, and Hybrid B heme peroxidases represent a distinctive mode of fungal-gene evolution within a large peroxidase-catalase superfamily that ranges from bacteria to plants. In this study, we focus on a detailed bioinformatics analysis of hyBpox genes, mainly within the genomes of Sclerotiniaceae (Ascomycota, Leotiomycetes), which is a specifically evolved fungal family of necrotrophic host generalists and saprophytic or biotrophic host specialists. Members of the genus Sclerotium produce only sclerotia and no fruiting bodies or spores. Thus, their physiological role for peroxidases remains open. A representative species, S. cepivorum, is a dangerous plant pathogen causing white rot in Allium species, particularly in onions, leeks, and garlic. On a worldwide basis, the white rot caused by this soil-borne fungus is apparently the most serious threat to Allium-crop production. We have also found very similar peroxidase sequences in the related fungus S. sclerotiorum, although with minor yet important modifications in the architecture of its active centre. The presence of ScephyBpox1-specific mRNA was confirmed by transcriptomic analysis. The presence of Hybrid B peroxidase at the protein level as the sole extracellular peroxidase of this fungus was confirmed in the secretome of S. cepivorum through detailed proteomic analyses. This prompted us to systematically search for all available genes coding for Hybrid B heme peroxidases in the whole fungal family of Sclerotiniaceae. We present here a reconstruction of their molecular phylogeny and analyse the unique aspects of their conserved-sequence features and structural folds in corresponding ancestral sequences. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | hybrid B heme peroxidase;peroxidase-catalase superfamily;oxidative stress;enzymatic antioxidant;ancestral sequence reconstruction |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.mdpi.com/2079-7737/11/3/459 |
| DOI výsledku | 10.3390/biology11030459 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | BIOLOGY-BASEL |
|---|---|
| ISSN | 2079-7737 |
| e-ISSN | 2079-7737 |
| Svazek periodika | 11 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 3 |
| Stát vydavatele periodika | CH - Švýcarská konfederace |
| Počet stran výsledku | 18 |
| Strana od-do | 1-18 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000776175200001 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85127589607 |
| Způsob publikování výsledku | A - Open Access |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2023 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/22:00126021!RIV23-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 28.05.2023 |
| Kontrolní číslo | 192479639 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2023 | RIV/00216224:14310/22:00126021 v dodávce dat RIV23-GA0-14310___ |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/00159816:_____/22:00077637 v dodávce dat RIV23-MSM-00159816 předkladatelem Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně |
|---|---|
| Dodáno MŠMT v roce 2023 | RIV/00216305:26230/22:PU144439 v dodávce dat RIV23-MSM-26230___ předkladatelem Vysoké učení technické v Brně / Fakulta informačních technologií |
| Dodáno MZ v roce 2023 | RIV/00159816:_____/22:00077637 v dodávce dat RIV23-MZ0-00159816 předkladatelem Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GJ | GJ20-15915Y - Studium molekulováho rozpoznávání a vývoj nových softwarových nástrojů pro identifikaci a design přístupových cest v proteinech (2020 - 2022) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018121 - Výzkumná infrastruktura RECETOX (2020 - 2022) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2018131 - Česká národní infrastruktura pro biologická data (2020 - 2022) |
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace |