Informační systém výzkumu,
vývoje a inovací

Rejstřík informací o výsledcích

Jednoduché vyhledávání

Zpět na hledáníHolocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae (2021)výskyt výsledku

Identifikační kód RIV/00216224:14310/21:00118909
Název v anglickém jazyce Holocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae
Druh J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost)
Poddruh J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp)
Jazyk eng - angličtina
Vědní obor 10611 - Plant sciences, botany
Rok uplatnění 2021
Kód důvěrnosti údajů S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů.
Počet výskytů výsledku 2
Počet tvůrců celkem 5
Počet domácích tvůrců 4
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců Petr Bureš (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4541057, orcid: 0000-0002-0146-956X, scopusid: 57195723293)
Marie Krátká (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8398481)
Jakub Šmerda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7248172)
František Zedek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6612229)
Kateřina Lojdová (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Popis výsledku v anglickém jazyce Centromere drive model describes an evolutionary process initiated by centromeric repeats expansion, which leads to the recruitment of excess kinetochore proteins and consequent preferential segregation of an expanded centromere to the egg during female asymmetric meiosis. In response to these selfish centromeres, the histone protein CenH3, which recruits kinetochore components, adaptively evolves to restore chromosomal parity and counter the detrimental effects of centromere drive. Holocentric chromosomes, whose kinetochores are assembled along entire chromosomes, have been hypothesized to prevent expanded centromeres from acquiring a selective advantage and initiating centromere drive. In such a case, CenH3 would be subjected to less frequent or no adaptive evolution. Using codon substitution models, we analyzed 36 CenH3 sequences from 35 species of the holocentric family Cyperaceae. We found 10 positively selected codons in the CenH3 gene [six codons in the N-terminus and four in the histone fold domain (HFD)] and six branches of its phylogeny along which the positive selection occurred. One of the positively selected codons was found in the centromere targeting domain (CATD) that directly interacts with DNA and its mutations may be important in centromere drive suppression. The frequency of these positive selection events was comparable to the frequency of positive selection in monocentric clades with asymmetric female meiosis. Taken together, these results suggest that preventing centromere drive is not the primary adaptive role of holocentric chromosomes, and their ability to suppress it likely depends on their kinetochore structure in meiosis.
Klíčová slova oddělená středníkem asymmetric meiosis;centromere drive;CenH3;holocentric chromosomes;monocentric chromosomes;symmetric meiosis;meiotic drive
Stránka www, na které se nachází výsledek https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.642661/full
DOI výsledku 10.3389/fpls.2021.642661
Odkaz na údaje z výzkumu -

Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku

Název periodika Frontiers in Plant Science
ISSN 1664-462X
e-ISSN -
Svazek periodika 12
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku February
Stát vydavatele periodika CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku 9
Strana od-do „642661“
Kód UT WoS článku podle Web of Science 000625490500001
EID výsledku v databázi Scopus 2-s2.0-85102311957
Způsob publikování výsledku A - Open Access
Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku -

Ostatní informace o výsledku

Předkladatel Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Dodavatel GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru 2022
Specifikace RIV/00216224:14310/21:00118909!RIV22-GA0-14310___
Datum poslední aktualizace výsledku 02.05.2022
Kontrolní číslo 192339016 ( v1.0 )

Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem

Dodáno MŠMT v roce 2022 RIV/00216224:14310/21:00118909 v dodávce dat RIV22-MSM-14310___

Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl

Projekt podporovaný GA ČR v programu GA GA20-15989S - Evoluce velikosti genomu - centromerický drajv v nové roli (2020 - 2022)
Projekt podporovaný MŠMT v programu LM LM2018140 - e-Infrastruktura CZ (2020 - 2022)
Vyhledávání ...