Zpět na hledání
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/19:00108109 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Architecture and Evolution of Blade Assembly in beta-propeller Lectins |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | J/A - Článek v odborném periodiku je obsažen v databázi Web of Science společností Thomson Reuters s příznakem „Article“, „Review“ nebo „Letter“ (Jimp) |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Vědní obor | 10400 - 1.4 Chemical sciences |
| Rok uplatnění | 2019 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Počet tvůrců celkem | 8 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Atul Kumar (státní příslušnost: IN - Indická republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3267323) Michaela Wimmerová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5522064, orcid: 0000-0002-7108-4198, scopusid: 6603457583, researcherid: A-4114-2010) Francois Bonnardel (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Anne Imberty (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Martina Lahmann (státní příslušnost: SE - Švédské království) Frederique Lisacek (státní příslušnost: CH - Švýcarská konfederace) Serge Perez (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) Annabelle Varrot (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Lectins with a beta-propeller fold bind glycans on the cell surface through multivalent binding sites and appropriate directionality. These proteins are formed by repeats of short domains, raising questions about evolutionary duplication. However, these repeats are difficult to detect in translated genomes and seldom correctly annotated in sequence databases. To address these issues, we defined the blade signature of the five types of beta-propellers using 3D-structural data. With these templates, we predicted 3,887 beta-propeller lectins in 1,889 species and organized this information in a searchable online database. The data reveal a widespread distribution of beta-propeller lectins across species. Prediction also emphasizes multiple architectures and led to the discovery of a beta-propeller assembly scenario. This was confirmed by producing and characterizing a predicted protein coded in the genome of Kordia zhangzhouensis. The crystal structure uncovers an intermediate in the evolution of beta-propeller assembly and demonstrates the power of our tools. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | lectin;beta-propellers |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0969212619300462?via%3Dihub |
| DOI výsledku | 10.1016/j.str.2019.02.002 |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Structure |
|---|---|
| ISSN | 0969-2126 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 27 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 5 |
| Stát vydavatele periodika | CH - Švýcarská konfederace |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Strana od-do | 764-775 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000467238900006 |
| EID výsledku v databázi Scopus | 2-s2.0-85064946243 |
| Způsob publikování výsledku | C - Omezený přístup (Restricted Access) |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2020 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/19:00108109!RIV20-GA0-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 15.05.2020 |
| Kontrolní číslo | 192193218 ( v1.0 ) |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno MŠMT v roce 2020 | RIV/00216224:14310/19:00108109 v dodávce dat RIV20-MSM-14310___/04:1 |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GA18-18964S - Lektiny a jejich úloha v interakci patogen/hostitel a buněčném rozpoznávání (2018 - 2020) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LM | LM2015043 - Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (2016 - 2017) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LQ | LQ1601 - CEITEC 2020 (2016 - 2020) |