| Identifikační kód |
RIV/00216224:14310/11:00050154 |
| Název v původním jazyce | Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí |
|---|
| Název v anglickém jazyce |
Mass-Spectrometry Quantification of Protein Biomarkers by Selected Reaction Monitoring |
| Druh |
J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh |
- |
| Jazyk |
cze - čeština |
| Obor - skupina |
C - Chemie |
| Obor |
CE - Biochemie |
| Rok uplatnění |
2011 |
| Kód důvěrnosti údajů |
S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku |
4 |
| Počet tvůrců celkem |
6 |
| Počet domácích tvůrců |
3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců |
Pavel Bouchal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2503786)
Jakub Faktor (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6223052)
Iva Struhárová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2474115)
Alena Fučíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Martin Hubálek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4407989)
Bořivoj Vojtěšek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 9637419) |
| Popis výsledku v původním jazyce | Monitorování vybraných reakcí (selected reaction monitoring, SRM) je kvantitativní hmotnostně-spektrometrická technika, která se stále více uplatňuje v kvantitativní analýze proteinů na bázi stanovení peptidů. Instrumentace sestává z nanoprůtokové kapalinové chromatografie spojené s ionizací elektrosprejem a hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kavdrupólu. První kvadrupól funguje jako hmotnostní filtr propouštějící vybraný peptid, který je fragmenován ve druhém kvadrupólu pomocí kolizí indukovanédisociace. Třetí kvadrupól propouští vybrané peptidové fragmenty, které následně dopadají na detektor. Tetnto přístup umož%nuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v jediné analýze s vysokou citlivostí a selektivitou. SRM se proto stává klíčovou metodou tzv. cílené proteomiky. Nejdůležitější aplikace spočívají ve výzkumu živých systémů kde SRM umožňuje rychlé, přesné a cenově přijatelné stanovení proteinů ve velkých počtech vzorků. |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce |
Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomicstoolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples. |
| Klíčová slova oddělená středníkem |
protein quantification; mass spectrometry; proteomics |
| Stránka www, na které se nachází výsledek |
- |
| Odkaz na údaje z výzkumu |
- |