Zpět na hledáníNanosecond Time-Dependent Stokes Shift at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenases (2009)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14310/09:00033990 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Nanosecond Time-Dependent Stokes Shift at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenases |
| Druh | J - Recenzovaný odborný článek (Jimp, Jsc a Jost) |
| Poddruh | - |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | C - Chemie |
| Obor | CE - Biochemie |
| Rok uplatnění | 2009 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 4 |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 5 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jan Brezovský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6084559) Jiří Damborský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1030175) Andrea Fořtová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9123377) Agniezska Olzynska (státní příslušnost: PL - Polská republika, domácí tvůrce: A) Zbyněk Zdráhal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4568567) Martin Hof (státní příslušnost: CZ - Česká republika) J. Sýkora (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The tunnel mouths are evolutionally the most variable regions in the structures of haloalkane dehalogenases originating from different bacterial species suggesting their importance for adaptation of enzymes to various substrates. We decided to monitor the dynamics of this particular region by means of time resolved fluorescence spectroscopy and molecular dynamic simulations. To label the enzyme specifically, we adapted a novel procedure that utilizes a coumarin dye containing a halide-hydrocarbon linker, which serves as a substrate for enzymatic reaction. The procedure leads to a coumarin dye covalently attached and specifically located in the tunnel mouth of the enzyme. In this manner, we stained two haloalkane dehalogenase mutants, DbjA-H280F and DhaA-H272F. The measurements of time-resolved fluorescence anisotropy, acrylamide quenching and time resolved emission spectra reveal differences in the polarity, accessibility and mobility of the dye and its microenvironment for both of the |
| Klíčová slova oddělená středníkem | tunnel mouths; haloalkane dehalogenases; DbjA-H280F and DhaA-H272F |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| Odkaz na údaje z výzkumu | - |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY |
|---|---|
| ISSN | 0002-7863 |
| e-ISSN | - |
| Svazek periodika | 0000 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 131 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Strana od-do | |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000262521800036 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
| Způsob publikování výsledku | - |
| Předpokládaný termín zveřejnění plného textu výsledku | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14310/09:00033990!RIV10-MSM-14310___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 21.05.2010 |
| Kontrolní číslo | 11791952 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno AV ČR v roce 2010 | RIV/61388955:_____/09:00333807 v dodávce dat RIV10-AV0-61388955/01:1 předkladatelem Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i. |
|---|---|
| Dodáno GA ČR v roce 2010 | RIV/61388955:_____/09:00333807 v dodávce dat RIV10-GA0-61388955/01:1 předkladatelem Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno MŠMT v roce 2010 | RIV/61388955:_____/09:00333807 v dodávce dat RIV10-MSM-61388955/01:1 předkladatelem Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i. |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LC | LC06010 - Centrum biokatalýzy a biotransformací (2006 - 2010) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LC | LC06063 - Fluorescenční mikroskopie v biologickém a lékařském výzkumu (2006 - 2010) |
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622412 - Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (2005 - 2011) |
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622413 - Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím (2005 - 2011) |
| Výzkumný záměr podporovaný MŠMT | MSM0021622415 - Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací (2005 - 2011) |
| Podpora / návaznosti | Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |